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Enregistrement W2978658748 · doi:10.1101/790287

Epigenetic regulation of protein translation in <i>KMT2A</i> -rearranged AML

2019· preprint· en· W2978658748 sur OpenAlexaff
Alexandra Lenard, Hongbo Xie, Simone S. Riedel, Zuo‐Fei Yuan, Nan Zhu, Tobias Neff, Kathrin M. Bernt

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensSmiths Detection (Canada)
Organismes subventionnairesUniversity of Colorado DenverChildren's Hospital ColoradoNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of PennsylvaniaChildren's Hospital of Philadelphia
Mots-clésEZH2PRC2Histone methyltransferaseMethyltransferaseHistone H3BiologyCancer researchEpigeneticsHistoneMethylationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Inhibition of the histone methyl-transferase DOT1L (KMT4) has shown encouraging activity in preclinical models of KMT2A ( MLL) -rearranged leukemia. The DOT1L inhibitor pinometostat (EPZ5676) was well tolerated in early phase clinical trials and showed modest clinical activity, including occasional complete responses (CRs) as single agent. These studies support the development of combinatorial therapies for KMT2A -rearranged leukemias. Here, we investigated two novel combinations: dual inhibition of the histone methyltransferases DOT1L and EZH2, and the combination of a DOT1L inhibitor with the protein synthesis inhibitor homoharringtonine (HHR). EZH2 is the catalytic histone methyltransferase in the polycomb repressive complex 2 (PRC2), and inhibition of EZH2 has reported preclinical activity in KMT2A -rearranged leukemia. We found that the H3K79 and H3K27 methyl marks are not dependent on each other, and that DOT1L and EZH2 inhibition affect largely distinct gene expression programs. In particular, the KMT2A/DOT1L target HOXA9, which is commonly de-repressed as a consequence of PRC2 loss or inhibition in other contexts, was not re-activated upon dual DOT1L/EZH2 knockout or inhibition. Despite encouraging data in murine KMT2A-MLLT3 transformed cells suggesting synergy between DOT1L and EZH2 inhibition, we found both synergistic and antagonistic effects on a panel of human KMT2A rearranged cell lines. Combinatorial inhibition of DOT1L and EZH2 is thus not a promising strategy. We identified opposing effects on ribosomal gene transcription and protein translation by DOT1L and EZH2 as a mechanism that is partially responsible for observed antagonistic effects. The effects of DOT1L inhibition on ribosomal gene expression prompted us to evaluate the combination of EPZ5676 with a protein translation inhibitor. EPZ5676 was synergistic with the protein translation inhibitor homoharringtonine (HHR), supporting further preclinical/clinical development of this combination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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