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Enregistrement W2979288789

Preliminary analysis of WND1B promoter from Populus trichocarpa

2012· article· en· W2979288789 sur OpenAlexaff
Gangbiao Xu

Notice bibliographique

RevueZhongnan Linye Keji Daxue xuebao · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensL'Alliance Boviteq
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPopulus trichocarpaGeneTATA boxPromoterBiologyGeneticsUntranslated regionRegulatory sequenceStart codonArabidopsisMolecular biologyGene expressionMessenger RNAGenomeMutant
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

WND1B gene from Populus trichocarpa is homologous to SND1,which is a key regulator of secondary wall synthesis in fiber cells of Arabidopsis.The 5' regulatory region of WND1B initiation codon advanced position about 2100 bp was cloned by PCR.TATA box,CAAT box and other core configurations were found in this promoter region.Several sequences similar to eukaryotic cis-regulatory elements were found in the 5'UTR proximal 5' flanking sequence.A series of truncated sequences of WND1B promoter were generated.The expression vectors pCAMBIA1301POG-1BP/1BP-F2/1BP-F3/1BP-F4-GUS were constructed and the transient expression analysis was carried out.The GUS activity determination revealed that the fragment of PtrWND1BP/ 1BP-F3/1BP-F4 could drive expression of the GUS gene while PtrWND1BP-F2 could not.The results suggested that the 5'UTR of PtrWND1B affected for the promoter activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,070
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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