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Enregistrement W2979929150 · doi:10.1182/blood.v104.11.215.215

Loss of Ubr1 Cooperatively Synergizes with HOX11 in B Cell Lymphomagenesis.

2004· article· en· W2979929150 sur OpenAlexaff
Edwin Chen, Suzana Rosic-Kablar, Lim S. Megan, Hough R. Margaret

Notice bibliographique

RevueBlood · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyProvirusInsertional mutagenesisMurine leukemia virusB cellMolecular biologySouthern blotRetrovirusBreakpointGene rearrangementGeneticsCancer researchGeneChromosomal translocationGenomeAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The HOX11 homeobox gene was originally identified at the recurrent t(10;14)(q24;q11) translocation breakpoint, a chromosomal abnormality observed in 5–7% of T cell acute lymphoblastic leukemias (T-ALLs). Transgenic mice ectopically expressing HOX11 in the B cell compartment die in their second year of life due to the onset of mature B cell lymphomas. However, the long latency prior to the development of leukemia has led to the hypothesis that additional mutations are necessary prior to the onset of full-blown malignancy. To identify collaborating genetic loci responsible for HOX11-induced B cell lymphomagenesis, proviral insertional mutagenesis, using the mature B cell-specific retrovirus, the murine AIDS (mAIDS) virus, was used. In eight of ten animals, there was an acceleration of development of B cell lymphomas, manifested by the development of a mediastinal mass comprising predominantly of mature IgM+ IgD+ B cells. Histological analysis revealed expansion of splenic germinal centres and hyperplasia of adjacent lymph nodes, consistent with diffuse large B cell lymphoma. Using the provirus as a molecular tag, we identified Ubr1 as a frequent site of proviral insertion. Three mice exhibited an insertion into the 10th exon of the Ubr1 gene, with two animals exhibiting an identical insertion at nucleotide 1295 and another animal exhibiting an insertion at nucleotide 1251. Insertion into this genomic region was confirmed by Southern blotting demonstrating the presence of a rearranged Ubr1 allele, and by the ability to generate a PCR amplicon across the viral-genome junction. Western immunoblot analysis revealed down-regulated expression of the Ubr1 gene product subsequent to viral integration. Ubr1 is a member of the E3 ubiquitin ligase family and participates in the ubiquitin-dependent proteolytic pathway. Among its numerous targets, Ubr1 controls the timely degradation of cohesin subunits during mitosis. Consequently, Ubr1−/−S. cerevisiae are prone to chromosome loss due to chromosome malsegregation during anaphase. We sought to investigate possible similar effects in primary B lymphocyte cultures derived from HOX11Tg/Ubr1+/+ and HOX11Tg/Ubr1−/− mice, and to determine whether HOX11 overexpression in such a Ubr1-null background possesses any synergizing effects on the ploidy of these cells. Direct counting of chromosome numbers from chromosome spreads prepared from HOX11Tg/Ubr1−/− primary B lymphocytes cultured in vitro for 4–5 days revealed increased incidences of aneuploidy and chromosome loss relative to HOX11wt/Ubr1−/− controls (2n=39.51 vs. 2n=39.98). Similarly, micronucleus assays indicated increased presence of micronuclei in HOX11Tg/Ubr1−/− primary B lymphocyte cultures (5.2% vs 0.8%). Additionally, HOX11Tg B lymphocytes exhibit increased cyclin B1 expression and an ability to bypass G2-M arrest induced by the tyrosine kinase inhibitor, genistein. Therefore, the effect of HOX11 in exacerbating chromosome loss in these cultures may be associated with its ability to allow cells to bypass the G2-M cell cycle checkpoint, permitting the accrual of additional chromosome losses and cytogenic abnormalities en route to malignancy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
Routes d'admission1
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