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Enregistrement W2979938421 · doi:10.3389/fonc.2019.01036

Hypoxia Can Induce Migration of Glioblastoma Cells Through a Methylation-Dependent Control of ODZ1 Gene Expression

2019· article· en· W2979938421 sur OpenAlexafffund
Carlos Velásquez, Sheila Mansouri, Olga Gutiérrez, Yasin Mamatjan, Pilar Mollinedo, Shirin Karimi, Olivia Singh, Nuria Terán, Juan Martino, Gelareh Zadeh, José L. Fernández-Luna

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health NetworkToronto Western HospitalPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIInstituto de Investigación Marqués de ValdecillaBrain Tumour Foundation of Canada
Mots-clésDownregulation and upregulationMethylationCancer researchCpG siteBiologyDNA methylationHypoxia (environmental)RHOATransactivationSOX2Regulation of gene expressionCell biologyGene expressionMolecular biologyChemistryGeneSignal transductionTranscription factorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The transmembrane protein ODZ1 has been associated with the invasive capacity of glioblastoma (GBM) cells through upregulation of RhoA/ROCK signaling, but the mechanisms triggering the ODZ1 pathway remain elusive. In addition, it is widely accepted that hypoxia is one of the main biological hallmarks of the GBM microenvironment and it is associated with treatment resistance and poor prognosis. Here we show that hypoxic tumor regions express higher levels of ODZ1 and that hypoxia induces ODZ1 expression in GBM cells by regulating the methylation status of the ODZ1 promoter. Hypoxia-induced upregulation of ODZ1 correlates with higher migration capacity of GBM cells that is drastically reduced by knocking down ODZ1. In vitro methylation of the promoter decreases its transactivation activity and we found a functionally active CpG site at the 3 ’end of the promoter. This site is hypermethylated in somatic neural cells and mainly hypomethylated in GBM cells. Mutagenesis of this CpG site reduces the promoter activity in response to hypoxia. Overall, we identify hypoxia as the first extracellular activator of ODZ1 expression and describe that hypoxia controls the levels of this migration-inducer, at least in part, by regulating the methylation status of the ODZ1 gene promoter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,520

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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