Lipopolysaccharide-stimulated, NF-kB-, miRNA-146a- and miRNA-155-mediated molecular-genetic communication between the human gastrointestinal tract microbiome and the brain
Notice bibliographique
Résumé
Through the use of RNA sequencing, microRNA (miRNA) and messenger RNA (mRNA) microfluidic array analysis, LED Northern, Western and ELISA analysis and multiple bioinformatics algorithms we have discovered a novel route for pathogenic communication between the human gastrointestinal (GI)-tract microbiome and the brain. The evidence suggests that this pathogenic gut-brain circuit involves: (i) lipopolysaccharide (LPS) from the GI-tract resident enterotoxigenic Gram-negative bacteria Bacteroides fragilis (BF-LPS); (ii) LPS transit across the GI-tract barrier into the systemic circulation; (iii) transport of a highly pro-inflammatory systemic BF-LPS across the blood-brain barrier (BBB) into the brain-parenchyma and neuronal-cytoplasm; (iv) activation and signaling via the pro-inflammatory NF-kB (p50/p65) transcription-factor complex; (v) NF-kB-coupling and significant up-regulation of the inducible pro-inflammatory microRNA-146a (miRNA-146a) and microRNA-155 (miRNA-155); each containing multiple NF-kB DNA-binding and activation sites in their immediate promoters; and (vi) subsequent down-regulation of miRNA-146a-miRNA-155 regulated mRNA targets such as that encoding complement factor H (CFH), a soluble complement control glycoprotein and key repressor of the innate-immune response. Down-regulated CFH expression activates the complement-system, the major non-cellular component of the innate-immune system while propagating neuro-inflammation. Other GI-tract microbes and their highly complex pro-inflammatory exudates may contribute to this pathogenic GI-tract-brain pathway. We speculate that it may be significant that the first Gram-negative anaerobic bacterial species intensively studied as a potential contributor to the onset of Alzheimer's disease (AD), that being the bacillus Bacteroides fragilis appears to utilize damaged or leaky physiological barriers and an activated NF-kB (p50-p65) - pro-inflammatory miRNA-146a-miRNA-155 signaling circuit to convey microbiome-derived pathogenic signals into the brain.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».