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Enregistrement W2980052074 · doi:10.5114/fn.2019.88449

Lipopolysaccharide-stimulated, NF-kB-, miRNA-146a- and miRNA-155-mediated molecular-genetic communication between the human gastrointestinal tract microbiome and the brain

2019· review· en· W2980052074 sur OpenAlexfundno aff
Peter N. Alexandrov, Yuhai Zhai, Wenhong Li, Walter J. Lukiw

Notice bibliographique

RevueFolia Neuropathologica · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institutes of HealthUniversity of California, IrvineUniversity of KentuckyUniversity of TorontoLouisiana State UniversityNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentMcLean HospitalHarvard UniversityLomonosov Moscow State UniversityUniversity of Pennsylvania
Mots-clésmicroRNAGastrointestinal tractMicrobiomeHuman gastrointestinal tractLipopolysaccharideBiologyBioinformaticsComputational biologyMedicineGeneticsImmunologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Through the use of RNA sequencing, microRNA (miRNA) and messenger RNA (mRNA) microfluidic array analysis, LED Northern, Western and ELISA analysis and multiple bioinformatics algorithms we have discovered a novel route for pathogenic communication between the human gastrointestinal (GI)-tract microbiome and the brain. The evidence suggests that this pathogenic gut-brain circuit involves: (i) lipopolysaccharide (LPS) from the GI-tract resident enterotoxigenic Gram-negative bacteria Bacteroides fragilis (BF-LPS); (ii) LPS transit across the GI-tract barrier into the systemic circulation; (iii) transport of a highly pro-inflammatory systemic BF-LPS across the blood-brain barrier (BBB) into the brain-parenchyma and neuronal-cytoplasm; (iv) activation and signaling via the pro-inflammatory NF-kB (p50/p65) transcription-factor complex; (v) NF-kB-coupling and significant up-regulation of the inducible pro-inflammatory microRNA-146a (miRNA-146a) and microRNA-155 (miRNA-155); each containing multiple NF-kB DNA-binding and activation sites in their immediate promoters; and (vi) subsequent down-regulation of miRNA-146a-miRNA-155 regulated mRNA targets such as that encoding complement factor H (CFH), a soluble complement control glycoprotein and key repressor of the innate-immune response. Down-regulated CFH expression activates the complement-system, the major non-cellular component of the innate-immune system while propagating neuro-inflammation. Other GI-tract microbes and their highly complex pro-inflammatory exudates may contribute to this pathogenic GI-tract-brain pathway. We speculate that it may be significant that the first Gram-negative anaerobic bacterial species intensively studied as a potential contributor to the onset of Alzheimer's disease (AD), that being the bacillus Bacteroides fragilis appears to utilize damaged or leaky physiological barriers and an activated NF-kB (p50-p65) - pro-inflammatory miRNA-146a-miRNA-155 signaling circuit to convey microbiome-derived pathogenic signals into the brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,946
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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