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Enregistrement W2980174566 · doi:10.1093/plankt/fbz050

Phylogeography of Neomysis americana (Crustacea, Mysida), focusing on the St. Lawrence system

2019· article· en· W2980174566 sur OpenAlexafffund
Grégoire Cortial, Ryan J. Woodland, Rachel Lasley-Rasher, Gesche Winkler

Notice bibliographique

RevueJournal of Plankton Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Biology and Ecology Research
Établissements canadiensUniversité du Québec à Rimouski
Organismes subventionnairesUniversité du Québec à Rimouski
Mots-clésPhylogeographyBiologyLineage (genetic)BayEstuarySpecies complexEcologyEuryhalineBiological dispersalGenetic structureIntraspecific competitionZoologyGenetic variationPhylogeneticsOceanographyPhylogenetic treeSalinityPopulationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Species characterized by low dispersal capacities, such as mysids, usually show evidence of genetic differentiation. Many mysids are broadly distributed and often show eurythermal and euryhaline traits. This study aimed to describe intraspecific genetic structure and the phylogeography of Neomysis americana, a key species of estuarine food webs in northwest Atlantic, using the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene. We sampled 26 populations across the St. Lawrence system (SLS) and two along the east coast of North America [Penobscot and Chesapeake Bay (CB)]. Sequencing of 420 individuals revealed three divergent (>3%) lineages (LA, LB, LC) across the sampling area suggesting that N. americana represents a cryptic species complex. The distribution of the lineages was geographically structured. LC occurred in the CB only, whereas LA and LB co-occurred along the SLS and Penobscot Bay. This suggests secondary contact after the last glacial maximum. In the SLS the lineage LA dominated the estuarine transition zone and the Gulf of St. Lawrence, whereas the lineage LB was prevalent in the lower St. Lawrence Estuary, potentially due to different eco-physiological preferences. These results might help to define reasonable entities for research and management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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