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Enregistrement W2980464316 · doi:10.1016/j.jalz.2019.06.2575

P2‐168: IMMUNOHISTOCHEMISTRY OF O‐LINKED N‐ACETYLGLUCOSAMINE TRANSFERASE (OGT) AND AUTOPHAGY MARKER LC3B IN ALZHEIMER'S DISEASE

2019· article· en· W2980464316 sur OpenAlexaff
Maya Lichtenstein, Nader Fallah, Howard Feldman, Ian R. Mackenzie, David J. Vocadlo

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunohistochemistryAutophagyStainingTransferaseCerebellumEnzymeCarbohydrate metabolismHippocampusBiologyBiochemistryEndocrinologyChemistryInternal medicinePathologyMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Early disturbances in brain glucose metabolism are characteristic in Alzheimer's Disease (AD). Modification of nuclear and cytoplasmic proteins with O-linked N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) is dependent on glucose availability. Increased O-GlcNAc levels have been linked to protein clearance of tau and amyloid precursor protein through autophagy in mouse models. Levels of O-GlcNAc are regulated in a dynamic manner through the action of the enzyme O-linked N-acetylglucosamine transferase (OGT), which installs O-GlcNAc, and β-N-acetylglucosaminidase (OGA), which removes this modification. With disturbances in brain glucose metabolism, including in diabetes mellitus (DM) and AD, O-GlcNAc effects are modified leading to decreased clearance of proteins related to AD. However, there are inconsistent results in reported levels of OGT in AD brain tissue. We set out to evaluate OGT and autophagy in human brains with and without AD and DM with immunohistochemistry (IHC) using semiquantative methods. We examined post mortem brain tissue from patients with pathologically confirmed AD (N=20) and without AD (N=20); with half of each group also having a history of DM. IHC-staining of paraffin-embedded tissue of frontal cortex (FC), hippocampus (HC) and cerebellum (CB) was undertaken for OGT and the autophagy marker LC3-B. Intensity of staining was graded semi-quantitatively from 0 to 4. OGT staining was significantly greater (p=0.016) and there was a trend for LC3-B staining to be less (p=0.057) in the HC of AD cases compared to controls. DM did not confer any differences in the analyses. Staining intensity of OGT differed across brain regions in this study, with increases in AD in the HC but not FC or cerebellum. Despite this apparent local upregulation of OGT, there was less evidence of autophagy, suggesting a signaling impairment in AD. The discordance between HC and FC is unexplained but may be related to the relatively higher burden of AD pathology in the HC. This study adds to the evidence that OGT may be increased in AD brains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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