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Enregistrement W2980520436 · doi:10.1073/pnas.1820843116

The PedBE clock accurately estimates DNA methylation age in pediatric buccal cells

2019· article· en· W2980520436 sur OpenAlexafffund
Lisa M. McEwen, Kieran J. O’Donnell, Megan McGill, Rachel D. Edgar, Meaghan J. Jones, Julia L. MacIsaac, David Lin, Katia E. Ramadori, Alexander M. Morin, Nicole Gladish, Elika Garg, Eva Unternäehrer, Irina Pokhvisneva, Neerja Karnani, Michelle Z. L. Kee, Torsten Klengel, Nancy E. Adler, Ronald G. Barr, Nicole Letourneau, Gerald F. Giesbrecht, James N. Reynolds, Darina Czamara, Jeffrey M. Armstrong, Marilyn J. Essex, Carolina de Weerth, Roseriet Beijers, Marieke S. Tollenaar, Bekh Bradley, Tanja Jovanović, Kerry J. Ressler, Meir Steiner, Sonja Entringer, Pathik D. Wadhwa, Claudia Buß, Nicole R. Bush, Elisabeth B. Binder, W. Thomas Boyce, Michael J. Meaney, Steve Horvath, Michael S. Kobor

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMcMaster UniversityQueen's UniversityAlberta Children's HospitalBC Children's HospitalUniversity of CalgaryMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteCanadian Institute for Advanced ResearchSt. Joseph’s Healthcare HamiltonUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of CanadaNational Institutes of HealthNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNational Institute of Mental HealthCanadian Institute for Advanced ResearchUniversity of California Berkeley
Mots-clésEpigeneticsEpigenomeDNA methylationBuccal swabBiologyGenetics5-HydroxymethylcytosineComputational biologyBioinformaticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OpenAlex consigne un résumé pour ce travail, mais il n'a pas pu être récupéré à l'instant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations291
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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