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Enregistrement W2980885763 · doi:10.1016/j.jalz.2019.08.077

P4‐530: PHOSPHORYLATED TAU INTERACTOME IN THE HUMAN ALZHEIMER'S DISEASE BRAIN

2019· article· en· W2980885763 sur OpenAlexaff
Eleanor Drummond, Geoffrey Pires, Claire MacMurray, Manor Askenazi, Shruti Nayak, Marie Bourdon, Beatrix Ueberheide, Thomas Wısnıewskı

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensQuest University Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInteractomeProteomicsTau proteinChemistryAlzheimer's disease14-3-3 proteinDiseaseNeurosciencePhosphorylationBiochemistryCell biologyBiologyPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Accumulation of phosphorylated tau (pTau) is a key pathological feature of Alzheimer's disease. pTau accumulation causes synaptic impairment, neuronal dysfunction and formation of neurofibrillary tangles. The pathological actions of pTau are likely mediated by surrounding neuronal proteins, however our knowledge of the specific proteins that pTau interacts with in Alzheimer's disease is surprisingly limited. Therefore, the aim of this study was to comprehensively map the pTau interactome for the first time. We used two complementary proteomics approaches to map the pTau interactome. First, quantitative proteomics was performed on neurofibrillary tangles microdissected from patients with advanced Alzheimer's disease (n=7 cases). Second, affinity purification-mass spectrometry was used to identify which of these proteins specifically bound to PHF1-immunoreactive pTau in the Alzheimer's disease brain (n=5 cases). 542 proteins were identified in neurofibrillary tangles. The abundant detection of proteins known to be present in neurofibrillary tangles including tau, ubiquitin, neurofilament proteins, ApoE and CDK5 validated our approach. Affinity purification-mass spectrometry confirmed that 75 of these 542 proteins were pTau binding partners. 34 proteins had been identified in previous studies to interact with pTau. More excitingly, an additional 34 proteins had previously been associated with Alzheimer's disease, but not linked directly to tau (e.g. synaptic protein VAMP2, RNA binding protein HNRNPA1), therefore we provide new evidence that their role in Alzheimer's disease likely involves their interaction with pTau. In addition, we also identified 7 novel proteins, not previously known to be associated with Alzheimer's disease or with tau. Network analysis showed that the pTau interactome was enriched in proteins involved in phagosome maturation and the protein ubiquitination pathway. Importantly, we were able to pinpoint the specific proteins that pTau interacts with in these pathways for the first time, therefore providing novel pathogenic mechanisms that can be explored in future studies. We present the first comprehensive analysis of the pTau interactome in the human Alzheimer's disease brain. These results reveal novel potential drug targets for the treatment of tauopathies and provide insight into how pTau mediates its pathological effects in Alzheimer's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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