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Enregistrement W2980898979 · doi:10.1002/iub.2184

Gata3 targets Runx1 in the embryonic haematopoietic stem cell niche

2019· article· en· W2980898979 sur OpenAlexfundno aff
Simon R. Fitch, Chrysa Kapeni, Aikaterini Tsitsopoulou, Nicola K. Wilson, Berthold Göttgens, Marella de Bruijn, Katrin Ottersbach

Notice bibliographique

RevueIUBMB Life · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCambridge Institute for Medical Research, University of CambridgeBlood Cancer UKWellcome TrustBloodwiseKay Kendall Leukaemia FundMedical Research CouncilBritish Society for HaematologyMedical Research Council Canada
Mots-clésRUNX1BiologyCell biologyHaematopoiesisEmbryonic stem cellStem cellTranscription factorStromal cellGATA3ImmunologyCancer researchGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Runx1 is an important haematopoietic transcription factor as stressed by its involvement in a number of haematological malignancies. Furthermore, it is a key regulator of the emergence of the first haematopoietic stem cells (HSCs) during development. The transcription factor Gata3 has also been linked to haematological disease and was shown to promote HSC production in the embryo by inducing the secretion of important niche factors. Both proteins are expressed in several different cell types within the aorta‐gonads‐mesonephros (AGM) region, in which the first HSCs are generated; however, a direct interaction between these two key transcription factors in the context of embryonic HSC production has not formally been demonstrated. In this current study, we have detected co‐localisation of Runx1 and Gata3 in rare sub‐aortic mesenchymal cells in the AGM. Furthermore, the expression of Runx1 is reduced in Gata3 −/− embryos, which also display a shift in HSC emergence. Using an AGM‐derived cell line as a model for the stromal microenvironment in the AGM and performing ChIP‐Seq and ChIP‐on‐chip experiments, we demonstrate that Runx1 , together with other key niche factors, is a direct target gene of Gata3. In addition, we can pinpoint Gata3 binding to the Runx1 locus at specific enhancer elements which are active in the microenvironment. These results reveal a direct interaction between Gata3 and Runx1 in the niche that supports embryonic HSCs and highlight a dual role for Runx1 in driving the transdifferentiation of haemogenic endothelial cells into HSCs as well as in the stromal cells that support this process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,635
Score d'incertitude au seuil0,934

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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