Genetic Diversity of African Mistletoe (<i>Loranthus micranthus</i> Linn.) Accessions from Selected Plant Hosts Using Internal Transcribed Spacer (<i>ITS</i>) Gene
Notice bibliographique
Résumé
African mistletoe ( Loranthus micranthus Linn.) is a parasitic plant which has shown to contain biologically active agents that have disease curing effects on humans. The present study aimed at evaluating the genetic diversity of L. micranthus accessions established on selected plant host based on ITS gene. 9 samples were selected for PCR amplification and sequencing of the its 1 and its 4 regions. The results revealed 104 and 89 polymorphic sites for its1 and its4 respectively. Haplotype diversity of 0.971+0.064 and nucleotide diversity 0.174+0.071 were recorded in its1 while haplotype diversity of 0.917+0.092 and nucleotide diversity of 0.231+0.027 were recorded in its4 . Phylogenetic analysis grouped the samples into 2 clusters based on the its regions. A high genetic distance (0.597) for its1 was obtained between samples from Pepper fruit and samples obtained from other host trees (African apple, Avocado and Monkey kola) while a low genetic distance (0.000) was obtained between C. apiculatum (LMV9) and African apple host (LMV4). The highest genetic distance (0.827) for its4 was obtained between C. apiculatum (LMV9) and African apple host (LMV4) while the lowest genetic distance (0.000) was obtained between Rubber hosts (LMV1, LMV2) and Pepper fruit host (LMV8). The results revealed some genetic diversity amongst the mistletoe grown on different hosts suggesting that host trees and geographical location might contribute to genetic diversity. It also showed that its1 and 4 regions differ in their variation discernment pattern in mistletoe and similar studies can be conducted in larger populations to accurately link genetic similarity/variation to host specificity and geographical origins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».