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Enregistrement W2980960612 · doi:10.5376/ijmeb.2019.09.0002

Genetic Diversity of African Mistletoe (<i>Loranthus micranthus</i> Linn.) Accessions from Selected Plant Hosts Using Internal Transcribed Spacer (<i>ITS</i>) Gene

2019· article· en· W2980960612 sur OpenAlexvenueno aff
A. N. Osuagwu, V. C. Oparaugo, E.E. Ekerette

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Evolution and Biodiversity · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenetic diversityBiologyHost (biology)BotanyGenetic distanceNucleotide diversityHorticultureGenetic variationHaplotypeGeneGenotypeGeneticsPopulationMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

African mistletoe ( Loranthus micranthus  Linn.) is a parasitic plant which has shown to contain biologically active agents that have disease curing effects on humans. The present study aimed at evaluating the genetic diversity of  L. micranthus  accessions established on selected plant host based on  ITS  gene. 9 samples were selected for PCR amplification and sequencing of the  its 1 and  its 4 regions. The results revealed 104 and 89 polymorphic sites for  its1  and  its4  respectively. Haplotype diversity of 0.971+0.064 and nucleotide diversity 0.174+0.071 were recorded in  its1  while haplotype diversity of 0.917+0.092 and nucleotide diversity of 0.231+0.027 were recorded in  its4 . Phylogenetic analysis grouped the samples into 2 clusters based on the  its  regions. A high genetic distance (0.597) for  its1  was obtained between samples from Pepper fruit and samples obtained from other host trees (African apple, Avocado and Monkey kola) while a low genetic distance (0.000) was obtained between  C. apiculatum  (LMV9) and African apple host (LMV4). The highest genetic distance (0.827) for  its4  was obtained between  C. apiculatum  (LMV9) and African apple host (LMV4) while the lowest genetic distance (0.000) was obtained between Rubber hosts (LMV1, LMV2) and Pepper fruit host (LMV8). The results revealed some genetic diversity amongst the mistletoe grown on different hosts suggesting that host trees and geographical location might contribute to genetic diversity. It also showed that  its1  and  4  regions differ in their variation discernment pattern in mistletoe and similar studies can be conducted in larger populations to accurately link genetic similarity/variation to host specificity and geographical origins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,918
Score d'incertitude au seuil0,707

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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