MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2981372844 · doi:10.1128/jvi.01325-19

A New Family of Small-Molecule CD4-Mimetic Compounds Contacts Highly Conserved Aspartic Acid 368 of HIV-1 gp120 and Mediates Antibody-Dependent Cellular Cytotoxicity

2019· article· en· W2981372844 sur OpenAlexafffund
Shilei Ding, Melissa C. Grenier‐Davies, William D. Tolbert, Dani Vézina, Rebekah Sherburn, Jonathan Richard, Jérémie Prévost, Jean-Philippe Chapleau, Gabrielle Gendron‐Lepage, Halima Medjahed, Cameron F. Abrams, Joseph Sodroski, Marzena Pazgier, Amos B. Smith, Andrés Finzi

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesSLAC National Accelerator LaboratoryBiological and Environmental ResearchBasic Energy SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchUniformed Services University of the Health SciencesNational Institute of General Medical SciencesamfAR, The Foundation for AIDS ResearchBrookhaven National LaboratoryU.S. Department of DefenseU.S. Department of EnergyOffice of ScienceCanada Research ChairsNational Institutes of HealthGovernment of Canada
Mots-clésEpitopeAntibody-dependent cell-mediated cytotoxicityGlycoproteinAntibodyBiologySmall moleculeViral envelopeVirologyTrimerVirusProtein structureHuman immunodeficiency virus (HIV)Cell biologyCytotoxicityBiochemistryIn vitroChemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HIV-1 has evolved multiple strategies to avoid humoral responses. One efficient mechanism is to keep its envelope glycoprotein (Env) in its "closed" conformation. Here, we report on a new family of small molecules that are able to "open up" Env, thus exposing vulnerable epitopes. This new family of molecules binds in the Phe43 cavity and contacts the highly conserved D368 residue. The structural and biological attributes of molecules of this family make them good candidates for drug development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of VirologyMême sujetHIV Research and TreatmentTravaux en français237 207