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Enregistrement W2981494509 · doi:10.1101/816082

Broad-Spectrum Antifungal Activities and Mechanism of Drimane Sesquiterpenoids

2019· preprint· en· W2981494509 sur OpenAlexaff
Edruce Edouarzin, Connor Horn, Anuja Paduyal, Cunli Zhang, Jianyu Lu, Zongbo Tong, Guri Giaever, Corey Nislow, Raja Veerapandian, Duy H. Hua, Govindsamy Vediyappan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesJohnson Cancer Research Center, Kansas State UniversityNational Institutes of HealthKing Saud UniversityUniversity of Missouri-Kansas CityMerck Sharp and DohmeUniversity of KansasKansas IDeA Network of Biomedical Research ExcellenceUniversity of Nebraska Medical Center
Mots-clésCorpus albicansCandida albicansBiologyMicrobiologyCryptococcus neoformansMutantGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Eight drimane sesquiterpenoids including (-)-drimenol and (+)-albicanol were synthesized from (+)-sclareolide and evaluated for their antifungal activities. Three compounds, (-)-drimenol, (+)-albicanol, and (1 R ,2 R ,4a S ,8a S )-2-hydroxy-2,5,5,8a-tetramethyl-decahydronaphthalene-1-carbaldehyde ( 4 ) showed strong activity against C. albicans . (-)-Drimenol, the strongest inhibitor of the three, (at concentrations of 8 – 64 μg/ml, causing 100% death of fungi), acts not only against C. albicans as a fungicidal manner, but also inhibits other fungi such as Aspergillus , Cryptococcus , Pneumocystis , Blastomyces , Fusarium , Rhizopus , Saksenaea and FLU resistant strains of C. albicans , C. glabrata, C. krusei , C. parapsilosis and C. auris. These observations suggest drimenol is a broad-spectrum antifungal agent. At high concentration (100 μg/ml), drimenol caused a rupture of the fungal cell wall/membrane. In a nematode model of C. albicans infection, drimenol rescued the worms from C. albicans -mediated death, indicating drimenol is tolerable and bioactive in a metazoan. Genome-wide fitness profiling assays of both S. cerevisiae (nonessential homozygous and essential heterozygous) and C. albicans (Tn-insertion mutants) collections revealed putative genes and pathways affected by drimenol. Using a C. albicans mutants spot assay, the Crk1 kinase associated gene products, Ret2, Cdc37, and novel putative targets orf19.759, orf19.1672, and orf19.4382 were revealed to be the potential targets of drimenol. Further, computational modeling results suggest possible modification of the structure of drimenol including the A ring for improving antifungal activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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