MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2981930255 · doi:10.3389/fgene.2019.01128

Transcriptome of Gonads From High Temperature Induced Sex Reversal During Sex Determination and Differentiation in Chinese Tongue Sole, Cynoglossus semilaevis

2019· article· en· W2981930255 sur OpenAlexfundno aff
Qian Wang, Kaiqiang Liu, Bo Feng, Zhihua Zhang, Renkai Wang, Lili Tang, Wensheng Li, Qiye Li, Francesc Piferrer, Changwei Shao

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Population and Public HealthKing Saud UniversityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésTranscriptomeKEGGBiologySexual differentiationGeneGeneticsSex reversalGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sex determination mechanisms in vertebrates can be broadly divided into genetic sex determination (GSD) and environmental sex determination (ESD). In addition, some fish species display plasticity during sex determination so that environmental factors can also alter the primary sex to the opposite direction without changing the genotype, a phenomenon called environmental sex reversal (ESR). Temperature is the main factor and thus elevated temperature can have a masculinizing effect. Previous studies on temperature-related ESR have been restricted to genes differentially expressed in mature gonads, or lacking a sex reversed pseudomale description. Thus, the molecular mechanism governing ESR remains a mystery in fish. The Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis) is a perfect suitable model to illuminate the relationship of sex-determination and temperature because the co-existence of GSD (genetic sex determination) and ESD (environmental sex determination). In the present study, undifferentiated gonads from genetic females and males, plus differentiated gonads from males, females, and pseudomales under high temperature and normal temperature treatment were used for comparative transcriptome analysis. A mean of 68.24 M high-quality clean reads were obtained from each library. The differentially expressed genes (DEGs) related to sex and environmental temperature identified that the heat shock protein gene family had an important role in sex reversal induced by high temperature. Enrichment analyses of GO terms and KEGG pathways showed that Neuroactive ligand-receptor interaction, Cortisol synthesis and secretion, and Steroid hormone biosynthesis may be involved in high temperature induced pseudomale formation. Furthermore, via weighted gene co-expression network analyses, two modules were identified to be significantly positive correlated with pseudomale under high temperature. An illustrated protein-protein interaction map drawn by the yellow module identified a hub gene, hsc70. These findings provide insights into the genetic framework underlying sex determination and sexual differentiation, as well as improve our understanding of the underlying ESR mechanism of sex reversal under high temperature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in GeneticsMême sujetGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal AbnormalitiesTravaux en français237 207