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Enregistrement W2981981251 · doi:10.1515/scid-2018-0005

Bayesian Design of Agricultural Disease Transmission Experiments for Individual Level Models

2019· article· en· W2981981251 sur OpenAlex
Grace P. S. Kwong, Rob Deardon, Scott Hunt, Michele T. Guerin

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueStatistical Communications in Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSet (abstract data type)Computer sciencePrior probabilityTransmission (telecommunications)Bayesian probabilityDesign of experimentsOptimal designDisease transmissionMathematical optimizationMonte Carlo methodFunction (biology)StatisticsSimulationMachine learningArtificial intelligenceMathematicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Here, we address the issue of experimental design for animal and crop disease transmission experiments, where the goal is to identify some characteristic of the underlying infectious disease system via a mechanistic disease transmission model. Design for such non-linear models is complicated by the fact that the optimal design depends upon the parameters of the model, so the problem is set in simulation-based, Bayesian framework using informative priors. This involves simulating the experiment over a given design repeatedly using parameter values drawn from the prior, calculating a Monte Carlo estimate of the utility function from those simulations for the given design, and then repeating this over the design space in order to find an optimal design or set of designs. Here we consider two agricultural scenarios. The first involves an experiment to characterize the effectiveness of a vaccine-based treatment on an animal disease in an in-barn setting. The design question of interest is on which days to make observations if we are limited to being able to observe the disease status of all animals on only two days. The second envisages a trial being carried out to estimate the spatio-temporal transmission dynamics of a crop disease. The design question considered here is how far apart to space the plants from each other to best capture those dynamics. In the in-barn animal experiment, we see that for the prior scenarios considered, observations taken very close to the beginning of the experiment tend to lead to designs with the highest values of our chosen utility functions. In the crop trial, we see that over the prior scenarios considered, spacing between plants is important for experimental performance, with plants being placed too close together being particularly deleterious to that performance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,497
Score d'incertitude au seuil0,211

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle