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Enregistrement W2982168455 · doi:10.1242/jeb.211623

Malpighian tubules of caterpillars: blending RNAseq and physiology to reveal regional functional diversity and novel epithelial ion transport control mechanisms

2019· article· en· W2982168455 sur OpenAlexafffund
Dennis Kolosov, Michael J. O’Donnell

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésReabsorptionMalpighian tubule systemBiologyIon channelSeptate junctionsIon transporterCell biologyHindgutTubuleReceptorSecretionRenal physiologyInsectAnatomyMidgutBiochemistryLarvaKidneyEndocrinologyBotanyIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malpighian tubules (MTs) and hindgut constitute the functional kidney of insects. MTs are outpouches of the gut and in most insects demonstrate proximodistal heterogeneity in function. In most insects, such heterogeneity is confined to ion/fluid secretion in the distal portion and ion/fluid reabsorption in the proximal portion. In contrast, MTs of larval Lepidoptera (caterpillars of butterflies and moths), are comprised of five regions that differ in their association with the gut, their structure, and ion/fluid transport function. Recent studies have shown that several regions can rapidly and reversibly switch between ion secretion and reabsorption. The current study employed RNAseq, pharmacology and electrophysiology to characterize four distinct regions of the MT in larval Trichoplusia ni. Luminal microelectrode measurements indicate changes in [K+], [Na+] and pH as fluid passes through different regions of the tubule. In addition, the regions examined differ in gene ontology enrichment, and demonstrate robust gradients in expression of ion transporters and endocrine ligand receptors. Lastly, the study provides evidence for direct involvement of voltage-gated and ligand-gated ion channels in epithelial ion transport of insect MTs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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