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Enregistrement W2982181481

Expression of Spaetzle Homologs 2-6 in Drosophila Larvae Hemocytes

2019· article· en· W2982181481 sur OpenAlexaff
Kyle Blacher

Notice bibliographique

RevueMacEwan University Student Research Proceedings · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensMacEwan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneComplementary DNAHomologous chromosomeDrosophila melanogasterMolecular biologyGene expressionRNACell biologyDrosophila (subgenus)Genetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Drosophila, the gene spaetzle (Spz) encodes a protein involved in the production of an immune cell called a hemocyte. Specifically, this protein triggers a signal transduction cascade (a series of intracellular chain reactions) in order to produce the immune cell. However, there are 5 other Spz homologs (genes that are similar to one another), and little is known about their role in hemocyte production. My goal was to specifically examine the expression of each Spz homolog in hemocyte cells. Using RNA extracted from hemocytes of Drosophila larvae, a RT-PCR (a method of amplifying RNA via a DNA intermediate) was conducted using primers specific to each homolog, and the PCR products were then run out through gel electrophoresis. The bands produced on the gel were then compared to the expected cDNA sizes of each Spz homolog from flybase to determine if there was expression of the homologs in hemocytes. The Spz homologs 2, and 3 consistently showed expression in Drosophila larvae hemocytes, while the homologs Spz 4, Spz 5 and Spz 6 also showed expression. However, the expression seen with these three homologs was not as consistent compared to the others. Therefore, the homologs Spz 2 and Spz 3 are clearly expressed in Drosophila larvae hemocyte cells.   Faculty Mentor: Agata Becalska Department: Biological Science

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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