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Enregistrement W2983661566 · doi:10.4049/jimmunol.1901072

CXCR3 Identifies Human Naive CD8+ T Cells with Enhanced Effector Differentiation Potential

2019· article· en· W2983661566 sur OpenAlexaff
Gabriele De Simone, Emilia Maria Cristina Mazza, Antonino Cassotta, Alexey N. Davydov, Mirela Kuka, Veronica Zanon, Fédérica De Paoli, Eloise Scamardella, Maria Metsger, Alessandra Roberto, Karolina Pilipow, Federico Colombo, Elena Tenedini, Enrico Tagliafico, Luca Gattinoni, Domenico Mavilio, Clelia Peano, David A. Price, Satya P. Singh, Joshua Μ. Farber, Valentina Serra, Francesco Cucca, Francesco Ferrari, Valeria Orrù, Edoardo Fiorillo, Matteo Iannacone, Dmitriy M. Chudakov, Federica Sallusto, Enrico Lugli

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesHumanitas Research HospitalNational Science FoundationAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroFondazione Italiana per la Ricerca sul CancroMinistero della SaluteWellcome TrustNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungHelmut Horten StiftungInstitute for Research in BiomedicineUniversity of MinnesotaEmory UniversityGiovanni Armenise-Harvard FoundationMinistry of Science and Higher Education of the Russian Federation
Mots-clésCXCR3EffectorCytotoxic T cellCell biologyBiologyImmunologyInflammationGeneticsChemokine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In mice, the ability of naive T (TN) cells to mount an effector response correlates with TCR sensitivity for self-derived Ags, which can be quantified indirectly by measuring surface expression levels of CD5. Equivalent findings have not been reported previously in humans. We identified two discrete subsets of human CD8+ TN cells, defined by the absence or presence of the chemokine receptor CXCR3. The more abundant CXCR3+ TN cell subset displayed an effector-like transcriptional profile and expressed TCRs with physicochemical characteristics indicative of enhanced interactions with peptide–HLA class I Ags. Moreover, CXCR3+ TN cells frequently produced IL-2 and TNF in response to nonspecific activation directly ex vivo and differentiated readily into Ag-specific effector cells in vitro. Comparative analyses further revealed that human CXCR3+ TN cells were transcriptionally equivalent to murine CXCR3+ TN cells, which expressed high levels of CD5. These findings provide support for the notion that effector differentiation is shaped by heterogeneity in the preimmune repertoire of human CD8+ T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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