CSIG-12. PREX1 LINKS ABERRANT PI 3-KINASE PATHWAY SIGNALING TO MAINTENANCE OF THE NEURAL STEM CELL-LIKE PHENOTYPE OF GLIOBLASTOMA CELLS
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Virtually all primary glioblastomas have aberrant activation of the PI 3-kinase pathway through mutational inactivation of tumour suppressors such as PTEN and/or mutational activation of oncogenes. Most glioblastomas also overexpress the Rac guanine nucleotide exchange factor PREX1, which is activated by PI 3-kinase pathway signaling. To determine the role of PREX1 in mediating the effects of aberrant PI 3-kinase pathway signaling in glioblastoma, we used CRISPR/Cas9 to knockout PREX1 in patient-derived glioblastoma cells cultured under conditions that maintain their neural stem cell-like characteristics. Multiple PREX1-null glioblastoma cell clones showed reduced motility and an altered morphology, with a smaller cell body and multiple neurite-like extensions. They also had increased expression of doublecortin, a marker of committed neurogenic progenitor cells. Analysis of RNA-seq data for transcription factor usage was consistent with the acquisition of an intermediate progenitor-like phenotype in PREX1-null cells, with loss of neural stem cell-associated polycomb repressive complex 2 and DMRTA2 activity and the expression of an EOMES/TBR2 signature characteristic of intermediate progenitors. The reduced motility, altered morphology and increase in doublecortin protein levels could all be reversed by re-expression of PREX1. PREX1-null cells had a reduced ability to phosphorylate and inactivate Lgl1, which is required for the maintenance of neural stem cell-like glioblastoma cell populations in vivo. These data show that PREX1 links aberrant PI 3-kinase signaling to maintenance of the neural stem cell-like phenotype in glioblastoma cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».