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Enregistrement W2984216090 · doi:10.1101/831321

Genome-wide association study identifies 48 common genetic variants associated with handedness

2019· preprint· en· W2984216090 sur OpenAlexaff
Gabriel Cuéllar-Partida, Joyce Y. Tung, Nicholas Eriksson, Eva Albrecht, Fazil Alıev, Ole A. Andreassen, Inês Barroso, J. Beckmann, Marco P. Boks, Dorret I. Boomsma, Heather A. Boyd, Monique M.B. Breteler, Harry Campbell, Daniel I. Chasman, Lynn Cherkas, Gail Davies, Eco J. C. de Geus, Ian J. Deary, Panos Deloukas, Danielle M. Dick, Johan G. Eriksson, Tõnu Esko, Bjarke Feenstra, Frank Geller, Christian Gieger, Ina Giegling, Scott D. Gordon, Jiali Han, Thomas Folkmann Hansen, Annette M. Hartmann, Caroline Hayward, Kauko Heikkilä, Andrew A. Hicks, Joel N. Hirschhorn, Jouke‐Jan Hottenga, Jennifer E. Huffman, Liang‐Dar Hwang, M. Arfan Ikram, Jaakko Kaprio, John P. Kemp, Kay‐Tee Khaw, Norman Klopp, Bettina Konte, Zoltán Kutalik, Jari Lahti, Xin Li, Ruth J. F. Loos, Michelle Luciano, Sigurður H. Magnússon, Massimo Mangino, Pedro Marques‐Vidal, Nicholas G. Martin, Wendy L. McArdle, Mark I. McCarthy, Carolina Medina‐Gómez, Mads Melbye, Scott A. Melville, Andres Metspalu, Lili Milani, Vincent Mooser, Mari Nelis, Dale R. Nyholt, Kevin S. O’Connell, Roel A. Ophoff, Cameron D. Palmer, Aarno Palotie, Teemu Palviainen, Guillaume Paré, Lavinia Paternoster, Leena Peltonen, Brenda W.J.H. Penninx, Ozren Polašek, Peter P. Pramstaller, Inga Prokopenko, Katri Räikkönen, Samuli Ripatti, Fernando Rivadeneira, Igor Rudan, Dan Rujescu, Johannes H. Smit, George Davey Smith, Jordan W. Smoller, Nicole Soranzo, Tim D. Spector, Beaté St Pourcain, John M. Starr, Hreinn Stefánsson, Stacy Steinberg, Maris Teder‐Laving, Guðmar Þorleifsson, Kāri Stefánsson, Nicholas J. Timpson, André G. Uitterlinden, Cornelia M. van Duijn, Frank J.A. van Rooij, Jaqueline M. Vink, Péter Vollenweider, Eero Vuoksimaa, Gérard Waeber, Nicholas J. Wareham, Nicole M. Warrington, Dawn Waterworth, Thomas Werge, H.‐Erich Wichmann, Elisabeth Widén, Gonneke Willemsen, Alan F. Wright, Margaret J. Wright, Mousheng Xu, Jing Hua Zhao, Peter Kraft, David A. Hinds, Cecilia M. Lindgren, Reedik Mägi, Benjamin M. Neale, David M. Evans, Sarah E. Medland

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHemispheric Asymmetry in Neuroscience
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesFP7 HealthNational Institutes of HealthErasmus Medisch CentrumNational Health and Medical Research CouncilAcademy of FinlandLi Ka Shing FoundationZonMwUniversity of QueenslandNational Institute for Health and Care ResearchFolkhälsanin TutkimussäätiöMedical Research CouncilSamfundet FolkhälsanNIHR Oxford Biomedical Research CentreNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome TrustEuropean Commission
Mots-clésGenome-wide association studyGenetic architectureHeritabilityBiologyPedigree chartBrain asymmetryGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGenetic associationGenetic correlationLateralization of brain functionGenetic variationNeuroscienceQuantitative trait locusGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Handedness, a consistent asymmetry in skill or use of the hands, has been studied extensively because of its relationship with language and the over-representation of left-handers in some neurodevelopmental disorders. Using data from the UK Biobank, 23andMe and 32 studies from the International Handedness Consortium, we conducted the world’s largest genome-wide association study of handedness (1,534,836 right-handed, 194,198 (11.0%) left-handed and 37,637 (2.1%) ambidextrous individuals). We found 41 genetic loci associated with left-handedness and seven associated with ambidexterity at genome-wide levels of significance (P < 5×10 −8 ). Tissue enrichment analysis implicated the central nervous system and brain tissues including the hippocampus and cerebrum in the etiology of left-handedness. Pathways including regulation of microtubules, neurogenesis, axonogenesis and hippocampus morphology were also highlighted. We found suggestive positive genetic correlations between being left-handed and some neuropsychiatric traits including schizophrenia and bipolar disorder. SNP heritability analyses indicated that additive genetic effects of genotyped variants explained 5.9% (95% CI = 5.8% – 6.0%) of the underlying liability of being left-handed, while the narrow sense heritability was estimated at 12% (95% CI = 7.2% – 17.7%). Further, we show that genetic correlation between left-handedness and ambidexterity is low (r g = 0.26; 95% CI = 0.08 – 0.43) implying that these traits are largely influenced by different genetic mechanisms. In conclusion, our findings suggest that handedness, like many other complex traits is highly polygenic, and that the genetic variants that predispose to left-handedness may underlie part of the association with some psychiatric disorders that has been observed in multiple observational studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Communication savante
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,381
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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