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Enregistrement W2985130805 · doi:10.1093/neuonc/noz175.994

STEM-21. INVESTIGATING DOT1L AS AN EPIGENETIC VULNERABILITY IN BRAIN TUMOR STEM CELLS

2019· article· en· W2985130805 sur OpenAlexaff
Danielle Bozek, Graham MacLeod, Xiaoguang Hao, Nishani Rajakulendran, Moloud Ahmadi, Peter B. Dirks, Stéphane Angers, Artee Luchman, Sam Weiss

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of CalgaryUniversity of TorontoSickKids FoundationOntario Brain Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStem cellBiologyCancer researchEpigeneticsNeural stem cellEmbryonic stem cellMethyltransferaseCancer stem cellCell biologyGeneticsMethylationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glioblastoma (GBM), the most common and aggressive primary adult brain cancer, is thought to be driven by a small subpopulation of brain tumor stem cells (BTSCs). BTSCs exhibit shared properties with normal stem cells such as self-renewal and multilineage differentiation. These stem cell properties have been proposed to underlie GBM tumorigenicity, treatment evasion and contribute to tumor heterogeneity. To investigate the biology underlying the stem cell properties of GBM, we compared gene essentiality profiles for a panel of BTSCs, fetal neural stem cells and non-GBM cell lines using a CRISPR Cas9 knockout library. Interestingly, from these screens, we identified the histone methyltransferase disrupter of telomeric silencing-1-like (DOT1L) as an essential gene for the growth of BTSCs and fetal neural stem cells but not for non-GBM cell lines. DOT1L is the only known histone methyltransferase responsible for histone 3 lysine 79 methylation, an epigenetic mark associated with active gene transcription. The role of this epigenetic regulator in BTSCs was investigated in depth using EPZ-5676, a clinically relevant small molecule inhibitor. Short-term treatment with EPZ-5676 in BTSCs showed minimal effects on cell viability but led to striking morphological changes, increased neuronal and astrocytic differentiation and a reduction in self-renewal. Longer treatment periods with EPZ-5676 led to a decrease in BTSC proliferation and an increase in apoptosis. Furthermore, BTSCs pretreated with EPZ-5676 led to slowed orthotopic tumor growth and improved overall survival in a SCID mouse model. Overall, these findings suggest DOT1L epigenetically regulates GBM stem cell properties and tumor growth. We are further investigating the mechanisms underlying DOT1L regulation of gene expression in BTSCs with the goal of improving the field’s understanding of epigenetics and the therapeutic implications of targeting epigenetic processes in GBM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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