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Enregistrement W2985930263 · doi:10.7554/elife.28131.028

Author response: AIRE is a critical spindle-associated protein in embryonic stem cells

2017· peer-review· en· W2985930263 sur OpenAlexaff
Bin Gu, Jean‐Philippe Lambert, Katie Cockburn, Anne‐Claude Gingras, Janet Rossant

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyEmbryonic stem cellMitosisCell biologyStem cellCentrosomeSpindle apparatusGeneticsComputational biologyCell divisionCellGeneCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Before the cells in our body separate to create copies of themselves, they need to duplicate their genetic material. To do so, they construct a machine called the spindle apparatus to divide their DNA evenly. In the embryo of mammals, embryonic stem cells – cells that can create all the cell types in adults – divide swiftly. This makes them prone to make mistakes that could affect the health of the organism they will develop into. To limit the number of errors, the embryonic stem cells divide more stringently and have more effective machineries to create a spindle apparatus. Together with a team of researchers, Gu previously showed that a gene and its protein called the ‘autoimmune regulator’, or AIRE for short, are highly active in embryonic stem cells and embryos. The autoimmune regulator usually plays an important role in helping immune cells to distinguish the body's own proteins from those of foreign invaders. It was also shown that some people suffering from fertility problems carry mutations in the AIRE gene. However, until now, it was not known if AIRE also had a specific role in embryonic stem cells. Using mouse embryonic stem cells and early embryos that were modified to either completely lack the AIRE gene or to produce a defective AIRE protein, Gu et al. now discovered a new purpose for AIRE. The AIRE protein interacted with a group of proteins that are associated with the spindle apparatus and was needed so that the spindle could form properly. When cells lacked the AIRE gene, a faulty spindle apparatus was assembled. Moreover, when a defective AIRE protein was produced, the structure of spindle apparatus in embryonic stem cells was also disrupted. A next step will be to further investigate how AIRE mutations could affect stem cell maintenance and fertility, which could lead to better ways to detect fertility defects in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil0,224

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0100,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0670,032

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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