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Enregistrement W2987494075 · doi:10.5038/2074-1235.47.2.1318

Mitochondrial DNA reveals genetic structure within the Atlantic but not Pacific populations of a holarctic seabird, the Black-legged Kittiwake Rissa tridactyla

2019· article· en· W2987494075 sur OpenAlexfundno aff
Drew Sauve, A. Patirana, J. Chardine, Vicki L. Friesen

Notice bibliographique

RevueMarine ornithology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSeabirdHolarcticOrnithologyBiologyMitochondrial DNAGeographyZoologyEcologySouthern HemisphereGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To predict evolutionary processes, such as speciation and local adaptation, we need to understand the mechanisms causing genetic differentiation of populations.We used mitochondrial control region sequence variation to investigate the genetic structure within and between Atlantic and Pacific populations of Black-legged Kittiwake (Rissa t. tridactyla and R. t. pollicaris, respectively).We predicted that genetic divergence of these populations, as in other northern hemisphere seabird species, might have been caused by glacial vicariance in the late Pleistocene.Further, because of regional differences in the morphology of kittiwakes, and the hypothesized historical vicariance, we predicted that genetic structure would exist within Atlantic but not Pacific populations.Population genetic and phylogenetic analyses of 756 base pairs of control region sequence for 398 kittiwakes indicated that Atlantic and Pacific populations are genetically differentiated from one another.Phylogenetic analyses indicated historical divergence of two mtDNA clades within the Pacific population and four mtDNA clades within the Atlantic population.Population genetic analyses indicated that colonies within the Atlantic were strongly differentiated from one another, which could be explained by restrictions in contemporary gene flow and historical fragmentation in historical refugia.Population genetic analyses provided little evidence for genetic structure in the Pacific population, which we attributed to longer time since vicariance, allowing more migration between colonies.Our results agree with current subspecies designations of Atlantic and Pacific populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,423
Score d'incertitude au seuil0,700

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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