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Enregistrement W2987809293 · doi:10.7554/elife.15258.017

Author response: The E3 ligase Ubr3 regulates Usher syndrome and MYH9 disorder proteins in the auditory organs of Drosophila and mammals

2016· peer-review· en· W2987809293 sur OpenAlexaff
Tongchao Li, Νικόλαος Γιαγτζόγλου, Daniel F. Eberl, Sonal Nagarkar-Jaiswal, Tiantian Cai, Dorothea Godt, Andrew K. Groves, Hugo J. Bellen

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHearing, Cochlea, Tinnitus, Genetics
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyosinBiologyGeneticsUbiquitin ligaseGenetic screenDrosophila melanogasterPhenocopyUsher syndromeGeneCell biologyMutantUbiquitin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over half of the world’s population has hearing loss by the age of 65, and inherited forms of deafness are responsible for many of the hearing impairments in newborn children. Because the auditory organs that enable insects and mammals to hear work in similar ways, we have learnt a lot about genetic forms of deafness from identifying faulty genes in humans and mice, and studying their effects in model organisms. Sensory cells in the inner ear respond to sound by detecting vibrations in the air and converting them into electrical impulses. A family of motor proteins called myosins play key roles in this conversion process. Mutations in the gene that produces one of these proteins, called myosin VIIa, cause an inherited deaf-blind disorder called Usher syndrome. Mutations in the gene for another type of myosin protein, called myosin II, also cause disorders associated with hearing loss, but it is not clear how they produce such effects. Li et al. have used Drosophila fruit flies to explore the role of myosin proteins in hearing by looking for genes that prevent the insect's auditory organ from developing or working properly. The search identified one gene called E3 ubiquitin ligase (ubr3), which is required for the auditory organ to develop normally and had not previously been implicated in deafness. Mutating the ubr3 gene caused a defect similar to that seen for mutations in the gene that produces the fruit fly equivalent of myosin VIIa. Through genetic and biochemical studies, Li et al. found that in the fruit flies, myosin VIIa interacts with myosin II. This interaction is regulated by a chemical modification of myosin II that is controlled by ubr3. Li et al. showed that the equivalent mammalian proteins display the same behaviour in the cells of mammals. Therefore, mutations that affect myosin II alter how the protein interacts with myosin VIIa, which explains why myosin II is associated with deafness in humans. In addition, Li et al. found that three other proteins that have been shown to cause Usher syndrome in humans have equivalents in flies and play a role in fly hearing. This will allow the Drosophila auditory organ to be further developed as a model system for future studies of deafness genes, and should provide insights into how specific genes are required for proper hearing in mammals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,997
Score d'incertitude au seuil0,977

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2920,121

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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