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Enregistrement W2988039790 · doi:10.3390/md17110643

Novel Microcystins from Planktothrix prolifica NIVA-CYA 544 Identified by LC-MS/MS, Functional Group Derivatization and 15N-labeling

2019· article· en· W2988039790 sur OpenAlex
Vittoria Mallia, Silvio Uhlig, Cheryl Rafuse, Juris Meija, Christopher O. Miles

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMarine Drugs · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésChemistryDerivatizationMicrocystinStereochemistryMass spectrometryAmino acidCyanobacteriaChromatographyBiochemistryBacteriaBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microcystins are cyclic heptapeptides from cyanobacteria that are potent inhibitors of protein phosphatases and are toxic to animals and humans. At present, more than 250 microcystin variants are known, with variants reported for all seven peptide moieties. While d-glutamic acid (d-Glu) is highly-conserved at position-6 of microcystins, there has been only one report of a cyanobacterium (Anabaena) producing microcystins containing l-Glu at the variable 2- and 4-positions. Liquid chromatography–mass spectrometry analyses of extracts from Planktothrix prolifica NIVA-CYA 544 led to the tentative identification of two new Glu-containing microcystins, [d-Asp3]MC-ER (12) and [d-Asp3]MC-EE (13). Structure determination was aided by thiol derivatization of the Mdha7-moiety and esterification of the carboxylic acid groups, while 15N-labeling of the culture and isotopic profile analysis assisted the determination of the number of nitrogen atoms present and the elemental composition of molecular and product-ions. The major microcystin analog in the extracts was [d-Asp3]MC-RR (1). A microcystin with an unprecedented high-molecular-mass (2116 Da) was also detected and tentatively identified as a sulfide-linked conjugate of [d-Asp3]MC-RR (15) by LC–HRMS/MS and sulfide oxidation, together with its sulfoxide (16) produced via autoxidation. Low levels of [d-Asp3]MC-RW (14), [d-Asp3]MC-LR (4), [d-Asp3,Mser7]MC-RR (11), [d-Asp3]MC-RY (17), [d-Asp3]MC-RF (18), [d-Asp3]MC-RR–glutathione conjugate (19), and [d-Asp3]MC-RCit (20), the first reported microcystin containing citrulline, were also identified in the extract, and an oxidized derivative of [d-Asp3]MC-RR and the cysteine conjugate of 1 were partially characterized.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,238
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle