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Enregistrement W2989780731 · doi:10.1071/rdv32n2ab82

82 Stage-specific expression of lineage marker genes and pluripotency marker distribution in porcine pre-implantation embryos

2019· article· en· W2989780731 sur OpenAlexaff
Joon Hak Oh, Mi Kyeong Lee, Daesu Lee, Kwang‐Hwan Choi, S. Kim, M. Cho, Changhyoup Lee

Notice bibliographique

RevueReproduction Fertility and Development · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomeobox protein NANOGSOX2EmbryoBiologyBlastocystInner cell massAndrologyZygoteMolecular biologyNanog Homeobox ProteinGene expressionRex1GeneEmbryonic stem cellGeneticsEmbryogenesisInduced pluripotent stem cellMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lineage specification in pre-implantation embryos has been revealed, and it was expedited recently by single cell studies. However, data on expression marker genes and proteins in porcine embryos were still missing. We aimed to investigate the expression and distribution of marker genes and proteins, respectively, in IVF and parthenogenetically activated (PA) embryos. For this, cumulus-free oocytes were co-incubated with sperm in modified Tris-buffered medium (mTBM) for 5 h and PA was performed using an electric pulse in activation medium. Following this, the embryos were incubated in porcine zygote medium 3 (PZM3). We first tested gene expression level of lineage candidates (internal control; β-actin). In IVF embryos (30, 25, 20, 15, 10, and 5 embryos pooled on Day 2, 3, 4, 5, 6, and 7; replicated 3 times), trophectoderm (TE)-specific genes (Dab2, Gata3) showed peaks on Day 4-5. Within the 2 genes, Dab2 had an earlier peak than Gata3. Inner cell mass (ICM) marker candidates (Nanog, Sox2, and Hnf4a) had diverse patterns. The Nanog and Sox2 genes had peak expression on Day 3. The Nanog expression dropped gradually, but Sox2 dropped suddenly on Day 4. Otherwise, Hnf4a expressed little in Day 3 and expression was sustained from Day 4 to 7. Primitive endoderm markers showed the highest expression on Day 4. We also checked expression level of ICM markers (Sox2, Oct4, and Nanog) in PA embryos (20, 20, 20, 10, and 5 embryos were pooled in 2, 4, 6-8 cells, morula, early, and late blastocyst stages; replicated 3 times). Expression of markers was similar (the highest in the 6-8-cell stage; at least 7.3-, 4.5-, and 3.7-fold compared with the other stages in Sox2, Oct4, and Nanog). We used analysis of variance and Tukey's test for statistical analysis. Following this, we conducted immunocytochemistry with both IVF and PA embryos (20 in each condition). Primary antibodies were treated overnight at 4°C and appropriate secondary antibodies were treated 1 h at room temperature. In the case of IVF, well-known ICM markers (SOX2, OCT4, NANOG, and SOX17) showed restricted distribution in nuclei of ICM cells. However, DAB2 was distributed in the cytoplasm of TE cells. In PA embryos, SOX2 and NANOG distributions were similar to IVF. The OCT4 in ICM cells from morula to early blastocyst was restricted, but not in Day 7 embryos. In conclusion, marker genes showed diverse expression pattern in IVF, but all ICM-specific genes had a similar pattern in PA. Also, ICM marker proteins were restricted in nuclei of ICM cells only except Day 7 PA. Our results provide eye-opening information on marker contribution to lineage specification of porcine embryos. This work was supported by the National Research Foundation in Korea (NRF) funded by the Ministry of Education (NRF-2017R1D1A1B03032256, NRF-2019R1C1C1004514).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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