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Enregistrement W2990018441 · doi:10.1136/sextrans-2019-sti.332

P173 Investigating varicella-zoster virus-specific T cells through the lenses of HIV

2019· article· en· W2990018441 sur OpenAlexaff
Carolina Campos Lima Moreira, Cátia T. Perciani, Thomas T. Murooka, Walter Jaoko, Kelly S. MacDonald, KAVI-ICR Team

Notice bibliographique

RevuePoster presentations · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyVaricella zoster virusCD8ImmunologyIL-2 receptorVirusT cellBiologyMedicineImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Varicella-zoster virus (VZV), also known as chickenpox virus, constitutes a promising vector for a successful HIV vaccine. As an effort to scrutinize its potential, we are characterizing the susceptibility of VZV-specific CD4 T cells to HIV infection and the phenotypic profile of both CD4 and CD8 T cells. Methods Blood T cells isolated from a cohort of healthy Kenyan women with pre-immunity to VZV (NCT02514018) were stimulated in vitro using 15-mer peptides representing VZV glycoprotein E (gE) and VZV Open Reading Frame 4 (ORF4). CD4 and CD8 T cell memory phenotypes were characterized by flow cytometry based on the expression of CCR7/CD45RA. The activation status of VZV-specific CD4 T cells was measured by the expression of HLA-DR, CD69, and CD25 after 6-day stimulation with gE and ORF4 peptides. Susceptibility to HIV infection was assessed using in vitro infection with a CCR5-tropic virus. DMSO and CMV peptides were used as negative and positive controls, respectively. Results A similar frequency of central memory CD4 T cells (TCM) (median 24%, IQR 18%-32%) and effector memory CD4 T cells (TEM) (median 27%, IQR 20%-32%) was observed in our cohort. The predominant CD8 memory subtype was TEMRA (median 28%, IQR 21%-40%) followed by TEM cells (median 12%, IQR 8%-19%) (n=45). Preliminary results show our ability to expand VZV-specific cells in culture using gE and ORF4 as stimuli and that these cells highly express the marker HLA-DR. Their susceptibility to in vitro HIV infection is currently under investigation using CMV-specific cells as comparator. Conclusion A viral vector able to sustain CD8 TEM responses without fueling the immune system with HIV target cells constitutes an ideal candidate for an HIV vaccine. Hence, our study sheds light on key aspects of VZV-specific immunity that will help determining its future as a vector in an HIV vaccine. Disclosure No significant relationships.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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Résumé présentoui

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