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Enregistrement W2990632541 · doi:10.2147/jir.s220960

<p>PtpA and PknG Proteins Secreted by <em>Mycobacterium avium</em> subsp. <em>paratuberculosis</em> are Recognized by Sera from Patients with Rheumatoid Arthritis: A Case–Control Study</p>

2019· article· en· W2990632541 sur OpenAlexaff
Marco Bo, Gian Luca Erre, Horacio Bach, Yael N. Slavin, Piera Angela Manchia, Giuseppe Passiu, Leonardo A. Sechi

Notice bibliographique

RevueJournal of Inflammation Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésParatuberculosisImmune systemAntibodyVirologyIRF5BiologyImmunologyMicrobiologyMycobacteriumMedicineInterferon regulatory factorsBacteriaGeneticsInnate immune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: Rheumatoid arthritis (RA) can result from complex interactions between the affected person’s genetic background and environment. Viral and bacterial infections may play a pathogenetic role in RA through different mechanisms of action. We aimed to evaluate the presence of antibodies (Abs) directed against two proteins of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) in sera of RA subjects, which are crucial for the survival of the pathogen within macrophages. Moreover, we analyzed the correlation of immune response to both proteins with the following homologous peptides: BOLF1 305–320 , MAP_4027 18–32 and IRF5 424–434 to understand how the synergic role of Epstein–Barr virus (EBV) and MAP infection in genetically predisposed subjects may lead to a possible deregulation of interferon regulatory factor 5 (IRF5). Materials and methods: The presence of Abs against protein tyrosine phosphatase A (PtpA) and protein kinase G (PknG) in sera from Sardinian RA patients (n=84) and healthy volunteers (HCs, n=79) was tested by indirect ELISA. Results: RA sera showed a remarkably high frequency of reactivity against PtpA in comparison to HCs (48.8% vs 7.6%; p <0.001) and lower but statistically significant responses towards PknG (27.4% vs 10.1%; p =0.0054). We found a significant linear correlation between the number of swollen joints and the concentrations of antibodies against PtpA ( p =0.018). Furthermore, a significant bivariate correlation between PtpA and MAP MAP_4027 18–32 peptide has been found, suggesting that MAP infection may induce a secondary immune response through cross-reaction with IRF5 (R 2 =0.5). Conclusion: PtpA and PknG are strongly recognized in RA which supports the hypothesis that MAP infection may be involved in the pathogenesis of RA. Keywords: Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis , PtpA, PknG, virulence factors, rheumatoid arthritis, immune response

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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