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Enregistrement W2990744283 · doi:10.1002/bit.27229

The phage display of <i>Bacillus subtilis</i> Lipase A significantly enhances catalytic activity due to altered nanoscale distribution in colloidal solution

2019· article· en· W2990744283 sur OpenAlexafffund
Sharifun Nahar, Esen Sokullu, Marc A. Gauthier

Notice bibliographique

RevueBiotechnology and Bioengineering · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBacillus subtilisLipaseNanoscopic scaleColloidChemistryDistribution (mathematics)Phage displayEnzymeCatalysisBiochemistryBiologyNanotechnologyBacteriaMaterials scienceOrganic chemistryPeptideMathematicsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Screening libraries of mutant proteins by phage display is now relatively common. However, one unknown factor is how the bacteriophage scaffold itself influences the properties of the displayed protein. This communication evaluates the effect of solution parameters on the catalytic activity of phage displayed Bacillus subtilis Lipase A (BSLA), compared to the free enzyme in solution. While the pH- and temperature-activity profiles of BSLA were not intrinsically affected by phage display, the nanoscale distribution of BSLA within the micellar assay buffer was. This lead to a pronounced increase of activity of phage-BSLA relative to the free enzyme, owing to the accumulation of phage-BSLA at the substrate-rich micelles. Considering this result obtained for BSLA, caution is warranted and similar effects should be considered when selecting other enzymes/proteins by phage display, as the activity of the displayed protein may differ from that of the free protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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