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Enregistrement W2990824525 · doi:10.1016/j.str.2019.11.005

Lipid Interactions of a Ciliary Membrane TRP Channel: Simulation and Structural Studies of Polycystin-2

2019· article· en· W2990824525 sur OpenAlexfundno aff
Qinrui Wang, Robin A. Corey, George Hedger, Prafulla Aryal, Mariana Grieben, Chady Nasrallah, Agnese Baronina, A.C.W. Pike, Jiye Shi, Elisabeth P. Carpenter, Mark S.P. Sansom

Notice bibliographique

RevueStructure · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesEngineering and Physical Sciences Research CouncilMedical Research CouncilJanssen BiotechInnovative Medicines InitiativeOntario Ministry of Economic Development and InnovationUCBWellcome TrustJanssen PharmaceuticalsMerck KGaAAbbVieMerckFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloGenome CanadaCanada Foundation for InnovationNovartisTakeda Pharmaceuticals U.S.A.PfizerBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilBoehringer Ingelheim
Mots-clésTransient receptor potential channelBiophysicsChemistryIon channelTransmembrane domainTRPC1TRPVPOPCBinding siteCell biologyMembraneBiochemistryTRPV1Lipid bilayerReceptorBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

and cholesterol interactions with PC2. PC2 is revealed to have a PIP binding site close to the equivalent vanilloid/lipid binding site in the TRPV1 channel. A 3.0-Å structure reveals a binding site for cholesterol on PC2. Cholesterol interactions with the channel at this site are characterized by MD simulations. The two classes of lipid binding sites are compared with sites observed in other TRPs and in Kv channels. These findings suggest PC2, in common with other ion channels, may be modulated by both PIPs and cholesterol, and position PC2 within an emerging model of the roles of lipids in the regulation and organization of ciliary membranes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,045

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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