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Enregistrement W2990866452 · doi:10.1111/febs.15147

Role of cardiac ryanodine receptor calmodulin‐binding domains in mediating the action of arrhythmogenic calmodulin N‐domain mutation N54I

2019· article· en· W2990866452 sur OpenAlexafffund
Mads T. Søndergaard, Yingjie Liu, Wenting Guo, Jinhong Wei, Ruiwu Wang, Malene Brohus, Michael T. Overgaard, S.R. Wayne Chen

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesInstitute of Circulatory and Respiratory HealthCanadian Institutes of Health ResearchNovo Nordisk FondenTeknologi og Produktion, Det Frie ForskningsrådLundbeckfondenHeart and Stroke Foundation of CanadaDet Obelske FamiliefondNatur og Univers, Det Frie Forskningsråd
Mots-clésCalmodulinRyanodine receptorMutationReceptorAction (physics)ChemistryDomain (mathematical analysis)Cell biologyInternal medicineCalciumBiologyBiochemistryMedicinePhysicsGeneMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Ca 2+ ‐sensing protein calmodulin (CaM) inhibits cardiac ryanodine receptor (RyR2)‐mediated Ca 2+ release. CaM mutations associated with arrhythmias and sudden cardiac death have been shown to diminish CaM‐dependent inhibition of RyR2, but the underlying mechanisms are not well understood. Nearly all arrhythmogenic CaM mutations identified are located in the C‐domain of CaM and exert marked effects on Ca 2+ binding to CaM and on the CaM C‐domain interaction with the CaM‐binding domain 2 (CaMBD2) in RyR2. Interestingly, the arrhythmogenic N‐domain mutation CaM‐N54I has little or no effect on Ca 2+ binding to CaM or the CaM C‐domain‐RyR2 CaMBD2 interaction, unlike all CaM C‐domain mutations. This suggests that CaM‐N54I may diminish CaM‐dependent RyR2 inhibition by affecting CaM N‐domain interactions with RyR2 CaMBDs other than CaMBD2. To explore this possibility, we assessed the effects of deleting each of the four known CaMBDs in RyR2 (CaMBD1a, ‐1b, ‐2, or ‐3) on the CaM‐dependent inhibition of RyR2‐mediated Ca 2+ release in HEK293 cells. We found that removing CaMBD1a, CaMBD1b, or CaMBD3 did not alter the effects of CaM‐N54I or CaM‐WT on RyR2 inhibition. On the other hand, deleting RyR2‐CaMBD2 abolished the effects of both CaM‐N54I and CaM‐WT. Our results support that CaM‐N54I causes aberrant RyR2 regulation via an uncharacterized CaMBD or less likely CaMBD2, and that RyR2 CaMBD2 is required for the actions of both N‐ and C‐domain CaM mutations. Moreover, our results show that CaMBD1a is central to RyR2 regulation, but CaMBD1a, CaMBD1b, and CaMBD3 are not required for CaM‐dependent inhibition of RyR2 in HEK293 cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,279
Score d'incertitude au seuil0,466

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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