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Enregistrement W2991103212 · doi:10.1002/cbic.201900635

Validation of <scp>l</scp>‐Tellurienylalanine as a Phenylalanine Isostere

2019· article· en· W2991103212 sur OpenAlexafffund
Nesrin Vurgun, Mark Nitz

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2019
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueOrganoselenium and organotellurium chemistry
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIsosterePhenylalanineChemistryStereochemistryBiochemistryComputational biologyAmino acidBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mass cytometry (MC) and imaging mass cytometry (IMC TM ) have emerged as important tools for the study of biological heterogeneity. We recently demonstrated the use of l ‐2‐tellurienylalanine (TePhe), a mimic of phenylalanine (Phe), as an MC‐ and IMC‐compatible protein synthesis reporter. In this work, the biochemical similarity of TePhe and its cognate analogue, Phe, are examined in the context of the RNase S complex. Isothermal titration calorimetry studies show that incorporation of TePhe preserves the interaction of S‐peptide with S‐protein, and the dissociation constants for the interaction of the Phe and TePhe peptides are within a factor of two. The resulting RNase S complex is catalytically active without significant alterations in the enzyme's kinetic parameters. Furthermore, circular dichroism spectroscopy does not reveal any changes to the secondary structure of TePhe‐substituted RNase S. These findings provide strong evidence that TePhe functions as a Phe isostere in the context of a folded protein. It is anticipated that incorporation of TePhe into peptides or peptidomimetic scaffolds will enable facile generation of MC and IMC TM probes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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