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Enregistrement W2991303675 · doi:10.5252/cryptogamie-algologie2019v40a10

Preliminary DNA Barcode Report on the Marine Red Algae (Rhodophyta) from the British Overseas Territory of Tristan da Cunha

2019· article· en· W2991303675 sur OpenAlexaffabout
Gary W. Saunders, Cody Brooks, Sue Scott

Notice bibliographique

RevueCryptogamie Algologie · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSporophyteBiologyDNA barcodingAlgaeGenusBotanyRed algaeFloristicsZoologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The current manuscript is the first in a series intended to publish accumulating DNA barcode data to make them accessible to the scientific community. Focused on 135 specimens of red algae from the remote islands of Tristan da Cunha, part of the British Overseas Territory of Saint Helena, Ascension and Tristan da Cunha, the 47 (possibly 48; see notes with Lophurella sp. 1Tris) genetic groups uncovered during this project are compared to the only detailed floristic work for this region completed by Baardseth in 1941. A number of taxonomic anomalies are reported with indications for eventual solutions that await study of the type material of the associated morphospecies. Species previously assigned by Baardseth to the genus Epymenia Kützing are formally transferred to Rhodymenia Greville as R. elongata (Baardseth), comb. nov., (including E. marginifera Baardseth) and R. flabellata (Baardseth), comb. nov. A number of range extensions are reported including species such as Ceramium secundatum (Lyngbye) C.Agardh, Colaconema caespitosum (J.Agardh) Jackelman, Stegenga & J.J.Bolton, Helminthocladia calvadosii (J.V.Lamour. ex Duby) Setch. and Porphyra mumfordii S.C.Lindstrom & K.M.Cole, which have likely been distributed by human activities. We also note that the sporophyte of the supposedly narrowly distributed Schimmelmannia elegans has been collected from both British Columbia, Canada, and Queensland, Australia, consistent with other observations that sporophytes of red algal species with alternations of heteromorphic generations are commonly more broadly distributed than the gametophytic stage. This species, although originally described by Baardseth from these mid Atlantic islands, may also be introduced.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,361
Score d'incertitude au seuil0,718

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0050,005
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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