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Enregistrement W2991701263 · doi:10.1126/science.aax1323

Embryonal precursors of Wilms tumor

2019· article· en· W2991701263 sur OpenAlexfundno aff
Tim Coorens, Taryn D. Treger, Reem Al‐Saadi, Luiza Moore, Maxine Tran, Thomas J. Mitchell, Suzanne Tugnait, Christine Thevanesan, Matthew D. Young, Thomas R. W. Oliver, Minou Oostveen, Grace Collord, Patrick Tarpey, Alex Cagan, Yvette Hooks, Mark Brougham, B. C. Reynolds, Giuseppe Barone, John Anderson, Mette Jorgensen, G. A. Amos Burke, Johannes Visser, James C. Nicholson, Naima Smeulders, Imran Mushtaq, Grant D. Stewart, Peter J. Campbell, David C. Wedge, Iñigo Martincorena, Dyanne Rampling, Liz Hook, Anne Y. Warren, Nicholas Coleman, Tanzina Chowdhury, Neil J. Sebire, Jarno Drost, Kourosh Saeb‐Parsy, Michael R. Stratton, Karin Straathof, Kathy Pritchard‐Jones, Sam Behjati

Notice bibliographique

RevueScience · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOncode InstituteLittle Princess TrustCambridge University HospitalsRoyal College of Surgeons of EnglandNational Institute for Health and Care ResearchSt. Baldrick's FoundationUniversity of CambridgeCancer Research UKHospital for Sick ChildrenWellcome TrustWellcome
Mots-clésWilms' tumorSomatic cellBiologyMutantCancerPathologyKidneyCancer researchMutationGeneticsMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A childhood tumor—from the beginning Many adult cancers arise from clonal expansions of mutant cells in normal tissue. These premalignant expansions are defined by somatic mutations shared by the cancers. Whether pediatric cancers originate in a similar way is unknown. Coorens et al. studied Wilms tumor, a childhood kidney cancer. Phylogenetic analyses revealed large clones of mutant cells in histologically and functionally normal kidney tissue long before tumor development. Thus, like adult tumors, Wilms tumor appears to arise from a premalignant tissue bed. Science , this issue p. 1247

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations159
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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