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Enregistrement W2992543001 · doi:10.1080/10937404.2019.1642586

Concordance between sites of tumor development in humans and in experimental animals for 111 agents that are carcinogenic to humans

2019· review· en· W2992543001 sur OpenAlexaff
Daniel Krewski, Jerry M. Rice, Michael G. Bird, Brittany Milton, Brian T. Collins, Pascale Lajoie, Mélissa Billard, Yann Grosse, Vincent James Cogliano, Jane C. Caldwell, Ivan Rusyn, Christopher J. Portier, Ronald L. Melnick, Robert A. Baan, Julian Little, Jan M. Zielinski

Notice bibliographique

RevueJournal of Toxicology and Environmental Health Part B · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesWorld Health Organization
Mots-clésCarcinogenConcordancePhysiologyCancerMedicineLarynxPathologyToxicologyInternal medicineOncologyBiologySurgeryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since the inception of the IARC Monographs Programme in the early 1970s, this Programme has developed 119 Monograph Volumes on more than 1000 agents for which there exists some evidence of cancer risk to humans. Of these, 120 agents were found to meet the criteria for classification as carcinogenic to humans (Group 1). Volume 100 of the IARC Monographs, compiled in 2008–2009 and published in 2012, provided a review and update of the 107 Group 1 agents identified as of 2009. These agents were divided into six broad categories: (I) pharmaceuticals; (II) biological agents; (III) arsenic, metals, fibers and dusts; (IV) radiation; (V) personal habits and indoor combustions; and (VI) chemical agents and related occupations. The Group I agents reviewed in Volume 100, as well as five additional Group 1 agents defined in subsequent Volumes of the Monographs, were used to assess the degree of concordance between sites where tumors originate in humans and experimental animals including mice, rats, hamsters, dogs, and non-human primates using an anatomically based tumor nomenclature system, representing 39 tumor sites and 14 organ and tissue systems. This evaluation identified 91 Group 1 agents with sufficient evidence (82 agents) or limited evidence (9 agents) of carcinogenicity in animals. The most common tumors observed in both humans and animals were those of the respiratory system including larynx, lung, and lower respiratory tract. In humans, respiratory system tumors were noted for 31 of the 111 distinct Group 1 carcinogens identified up to and including Volume 109 of the IARC Monographs, comprising predominantly 14 chemical agents and related occupations in category VI; seven arsenic, metals, fibers, and dusts in category III, and five personal habits and indoor combustions in category V. Subsequent to respiratory system tumors, those in lymphoid and hematopoietic tissues (26 agents), the urothelium (18 agents), and the upper aerodigestive tract (16 agents) were most often seen in humans, while tumors in digestive organs (19 agents), skin (18 agents), and connective tissues (17 agents) were frequently seen in animals. Exposures to radiation, particularly X- and γ-radiation, and tobacco smoke were associated with tumors at multiple sites in humans. Although the IARC Monographs did not emphasize tumor site concordance between animals and humans, substantial concordance was detected for several organ and tissue systems, even under the stringent criteria for sufficient evidence of carcinogenicity used by IARC. Of the 60 agents for which at least one tumor site was identified in both humans and animals, 52 (87%) exhibited tumors in at least one of the same organ and tissue systems in humans and animals. It should be noted that some caution is needed in interpreting concordance at sites where sample size is particularly small. Although perfect (100%) concordance was noted for agents that induce tumors of the mesothelium, only two Group 1 agents that met the criteria for inclusion in the concordance analysis caused tumors at this site. Although the present analysis demonstrates good concordance between animals and humans for many, but not all, tumor sites, limitations of available data may result in underestimation of concordance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,099
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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