Set1/COMPASS repels heterochromatin invasion at euchromatic sites by disrupting Suv39/Clr4 activity and nucleosome stability
Notice bibliographique
Résumé
Protection of euchromatin from invasion by gene-repressive heterochromatin is critical for cellular health and viability. In addition to constitutive loci such as pericentromeres and subtelomeres, heterochromatin can be found interspersed in gene-rich euchromatin, where it regulates gene expression pertinent to cell fate. While heterochromatin and euchromatin are globally poised for mutual antagonism, the mechanisms underlying precise spatial encoding of heterochromatin containment within euchromatic sites remain opaque. We investigated ectopic heterochromatin invasion by manipulating the fission yeast mating type locus boundary using a single-cell spreading reporter system. We found that heterochromatin repulsion is locally encoded by Set1/COMPASS on certain actively transcribed genes and that this protective role is most prominent at heterochromatin islands, small domains interspersed in euchromatin that regulate cell fate specifiers. Sensitivity to invasion by heterochromatin, surprisingly, is not dependent on Set1 altering overall gene expression levels. Rather, the gene-protective effect is strictly dependent on Set1's catalytic activity. H3K4 methylation, the Set1 product, antagonizes spreading in two ways: directly inhibiting catalysis by Suv39/Clr4 and locally disrupting nucleosome stability. Taken together, these results describe a mechanism for spatial encoding of euchromatic signals that repel heterochromatin invasion.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».