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Enregistrement W2994033895 · doi:10.1530/erc-19-0420

The epigenetic and transcriptional landscape of neuroendocrine prostate cancer

2019· review· en· W2994033895 sur OpenAlexafffund
Alastair Davies, Amina Zoubeidi, Luke A. Selth

Notice bibliographique

RevueEndocrine Related Cancer · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchMedical Research CouncilProstate Cancer Foundation
Mots-clésEpigeneticsReprogrammingBiologyProstate cancerEpigenomeLineage (genetic)Cancer researchDNA methylationPhenotypeCancerTranscription factorGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tumours adapt to increasingly potent targeted therapies by transitioning to alternative lineage states. In prostate cancer, the widespread clinical application of androgen receptor (AR) pathway inhibitors has led to the insurgence of tumours relapsing with a neuroendocrine phenotype, termed neuroendocrine prostate cancer (NEPC). Recent evidence suggests that this lineage reprogramming is driven largely by dysregulation of the epigenome and transcriptional networks. Indeed, aberrant DNA methylation patterning and altered expression of epigenetic modifiers, such as EZH2, transcription factors, and RNA-modifying factors, are hallmarks of NEPC tumours. In this review, we explore the nature of the epigenetic and transcriptional landscape as prostate cancer cells lose their AR-imposed identity and transition to the neuroendocrine lineage. Beyond addressing the mechanisms underlying epithelial-to-neuroendocrine lineage reprogramming, we discuss how oncogenic signaling and metabolic shifts fuel epigenetic/transcriptional changes as well as the current state of epigenetic therapies for NEPC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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