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Enregistrement W2994442551 · doi:10.1182/blood.v112.11.1078.1078

A Novel Strategy for Expanding Primitive Leukemic Cells from Chronic Phase CML Patients by Forced Overexpression of a NUP98-HOXA10 Homeodomain Fusion Gene.

2008· article· en· W2994442551 sur OpenAlexaff
Ivan Sloma, Suzan Imren, Yun Zhao, R. Keith Humphries, Connie J. Eaves

Notice bibliographique

RevueBlood · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Myeloid Leukemia Treatments
Établissements canadiensTerry Fox Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBone marrowHaematopoiesisCD34Stem cellBiologyHomeoboxFusion geneLeukemiaImmunologyCancer researchMolecular biologyGeneCell biologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Analysis of the leukemic stem cell compartment in CML patients with chronic phase disease remains a major challenge. This is due to the usually low frequency of these cells in the bone marrow and blood of most patients regardless of the WBC count and the fact that they are typically outnumbered by normal hematopoietic stem cells from which they cannot be currently separated. Moreover, thus far it has not been possible to identify conditions for their selective expansion in vitro or in vivo. To pursue this goal, we have begun to explore the effects of certain HOX gene-containing constructs on primitive chronic phase CML cells based on previous evidence that these genes markedly enhance the expansion of primitive normal murine and human cord blood cell numbers without inducing leukemia. Lineage-negative peripheral blood or bone marrow cells from 3 chronic phase CML patients (with >93%, <20% and <6% Ph+ LTC-ICs by G-banding karyotyping) were pre-stimulated overnight in a medium containing a serum substitute and 100 ng/ml hSteel Factor (SF), 100 ng/ml hFlt3-ligand and 20 ng/ml each of hIL-3, hIL-6 and hG-CSF. Cells were then exposed to a lenti-PGK-GFP virus with or without an upstream MDUS-NUP98-HOXA10 homeodomain (HD) element for 5 hours in the same medium. After removal of the virus, the cells were maintained in culture under the same conditions for 2 more days to allow full expression of the transduced genes. At this point, both cultures contained the same number of total cells, GFP+ cells and clonogenic progenitors (BFU-E + CFU-GM + CFU-GEMM); i.e., 2.2±0.5 x105 vs 2.2±0.6 x105 total cells, 1.0±0.2 x105 vs 1.3±0.3 x105 GFP+ cells, 3.6±1.7 x104 vs 3.4±1.7 x104 total CFCs and 1.7±0.9 x104 vs 2.4±1.3 x104 GFP+ CFCs per 105 starting lin- cells. However, after the 2-day post-transduction, cells had been maintained for 6 weeks in longterm cultures (LTCs) containing murine stromal cells producing hIL-3, hSF and hG-CSF, we noted a markedly higher (4 to 74-fold) output of CFCs from the NUP98-HOXA10HD-transduced cells. Moreover, whereas the proportion of GFP+ CFCs in the 2-day post-transduction cultures was on average only 31% and 48 % for the control and tested cells respectively, this increased to >98% in the 6-week LTCs initiated with cells that were overexpressing NUP98-HOXA10HD but remained constant at 39% in the control LTCs - suggesting a significant growth advantage conferred by the NUP98A10HD transgene. Importantly, RT-PCR genotyping of the colonies in these assays showed the majority of LTC-IC-derived CFCs from the NUP98-HOXA10HD-transduced cells to be BCR-ABL+, indicative of an even greater output of CFCs by the NUP98-HOXA10HD transduced BCR-ABL+ vs normal cells. These results highlight the potential of NUP98-HOXA10HD to selectively expand primitive CML cells isolated directly from chronic phase patients which will facilitate their further investigation and use to screen and validate new therapeutic agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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