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Enregistrement W2995180419 · doi:10.1684/vir.2017.0707

The interferon-induced protein kinase R: the base of a riboprotein scaffolding regulating the human immunodeficiency virus.

2017· article· en· W2995180419 sur OpenAlexaff
Aı̈cha Daher, Roman P. Labbé, Roman Radetskyy, Anne Gatignol

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtein kinase RInterferonBiologyEIF-2 kinaseRNAViral replicationeIF2VirologyProtein kinase AVirusKinaseCell biologyMolecular biologyMitogen-activated protein kinase kinaseCyclin-dependent kinase 2BiochemistryRibosomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interferon-induced RNA-activated Protein Kinase (PKR) targets the alpha subunit of the eukaryotic translation initiation factor 2 (eIF2α) whose phosphorylation blocks translation initiation of cellular and viral mRNAs. PKR is activated at the beginning of human immunodeficiency virus (HIV) infection by low levels of the HIV Transactivation Response (TAR) RNA and by the cellular PKR Activator (PACT), which contributes to a reduced viral replication. During HIV replication, the viral Tat protein and high production of TAR RNA decrease PKR activation. The cellular TAR RNA Binding Protein (TRBP) and Adenosine Deaminase Acting on RNA (ADAR1) also prevent PKR activation, while HIV expression changes PACT function to become a PKR inhibitor. Therefore, HIV recruits viral and cellular factors to counteract PKR antiviral activity. In addition, PKR antiviral function was positively selected during evolution due to contacts with viral factors inhibiting its function. The riboprotein scaffolding such as the one that inhibits PKR during HIV replication may exist for other antiviral factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,254
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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