Replication Study: Biomechanical remodeling of the microenvironment by stromal caveolin-1 favors tumor invasion and metastasis
Notice bibliographique
Résumé
As part of the Reproducibility Project: Cancer Biology we published a Registered Report (Fiering et al., 2015) that described how we intended to replicate selected experiments from the paper ‘Biomechanical remodeling of the microenvironment by stromal caveolin-1 favors tumor invasion and metastasis’ (Goetz et al., 2011). Here we report the results. Primary mouse embryonic fibroblasts (pMEFs) expressing caveolin 1 (Cav1WT) demonstrated increased extracellular matrix remodeling in vitro compared to Cav1 deficient (Cav1KO) pMEFs, similar to the original study (Goetz et al., 2011). In vivo, we found higher levels of intratumoral stroma remodeling, determined by fibronectin fiber orientation, in tumors from cancer cells co-injected with Cav1WT pMEFs compared to cancer cells only or cancer cells plus Cav1KO pMEFs, which were in the same direction as the original study (Supplemental Figure S7C; Goetz et al., 2011), but not statistically significant. Primary tumor growth was similar between conditions, like the original study (Supplemental Figure S7Ca; Goetz et al., 2011). We found metastatic burden was similar between Cav1WT and Cav1KO pMEFs, while the original study found increased metastases with Cav1WT (Figure 7C; Goetz et al., 2011); however, the duration of our in vivo experiments (45 days) were much shorter than in the study by Goetz et al. (2011) (75 days). This makes it difficult to interpret the difference between the studies as it is possible that the cells required more time to manifest the difference between treatments observed by Goetz et al. We also found a statistically significant negative correlation of intratumoral remodeling with metastatic burden, while the original study found a statistically significant positive correlation (Figure 7Cd; Goetz et al., 2011), but again there were differences between the studies in terms of the duration of the metastasis studies and the imaging approaches that could have impacted the outcomes. Finally, we report meta-analyses for each result.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».