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Enregistrement W2996428715 · doi:10.1111/mec.15329

Ancient DNA suggests modern wolves trace their origin to a Late Pleistocene expansion from Beringia

2019· article· en· W2996428715 sur OpenAlexafffund
Liisa Loog, Olaf Thalmann, Mikkel‐Holger S. Sinding, Verena J. Schuenemann, Angela Perri, Mietje Germonpré, Hervé Bocherens, Kelsey E. Witt, Jose A. Samaniego Castruita, Marcela Sandoval‐Velasco, Inge Lundstrøm, Nathan Wales, Gontran Sonet, Laurent Frantz, Hannes Schroeder, Jane Budd, Elodie‐Laure Jimenez, Sergey Fedorov, Boris Gasparyan, Andrew W. Kandel, Martina Lázničková‐Galetová, Hannes Napierala, Hans-Peter Uerpmann, Pavel A. Nikolskiy, Elena Y. Pavlova, Vladimir V. Pitulko, Karl‐Heinz Herzig, Ripan S. Malhi, Eske Willerslev, Anders J. Hansen, Keith Dobney, M. Thomas P. Gilbert, Johannes Krause, Greger Larson, Anders Eriksson, Andrea Manica

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWildlife Ecology and Conservation
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilNatural Environment Research CouncilUniversity of AlbertaH. Lundbeck A/SMax-Planck-GesellschaftLundbeckfondenHorizon 2020 Framework ProgrammeAage og Johanne Louis-Hansens FondGrantová Agentura České RepublikySight Research UKMuseum of the North, University of AlaskaRussian Science FoundationVelux Fonden
Mots-clésBeringiaAncient DNABiologyPleistoceneTRACE (psycholinguistics)Trace fossilArchaeologyPaleontologyEvolutionary biologyPopulationHistory

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Grey wolves (Canis lupus) are one of the few large terrestrial carnivores that have maintained a wide geographical distribution across the Northern Hemisphere throughout the Pleistocene and Holocene. Recent genetic studies have suggested that, despite this continuous presence, major demographic changes occurred in wolf populations between the Late Pleistocene and early Holocene, and that extant wolves trace their ancestry to a single Late Pleistocene population. Both the geographical origin of this ancestral population and how it became widespread remain unknown. Here, we used a spatially and temporally explicit modelling framework to analyse a data set of 90 modern and 45 ancient mitochondrial wolf genomes from across the Northern Hemisphere, spanning the last 50,000 years. Our results suggest that contemporary wolf populations trace their ancestry to an expansion from Beringia at the end of the Last Glacial Maximum, and that this process was most likely driven by Late Pleistocene ecological fluctuations that occurred across the Northern Hemisphere. This study provides direct ancient genetic evidence that long-range migration has played an important role in the population history of a large carnivore, and provides insight into how wolves survived the wave of megafaunal extinctions at the end of the last glaciation. Moreover, because Late Pleistocene grey wolves were the likely source from which all modern dogs trace their origins, the demographic history described in this study has fundamental implications for understanding the geographical origin of the dog.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,376
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations116
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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