The long non-coding RNA <i>Cancer Susceptibility 15</i> (<i>CASC15</i>) is induced by isocitrate dehydrogenase (IDH) mutations and maintains an immature phenotype in adult acute myeloid leukemia
Notice bibliographique
Résumé
We and others recently showed that coordinated expression of long non-coding (lnc)RNA is essential for myeloid differentiation and that, in turn, deregulation of lncRNA contributes to the pathogenesis of acute myeloid leukemia (AML). 1 To better understand the relationship between lncRNA that control granulopoiesis and the block of differentiation in AML blasts, we sequenced stranded, non-poly-A-enriched cDNA libraries that were prepared from healthy human donor bone marrow (deposited under GEO accession number #GSE98946). Within this dataset, expression of the lncRNA Cancer Susceptibility 15 (CASC15) was significantly inversely correlated with myeloid differentiation and highly enriched in myeloblasts, 1 which suggests a role in maintaining stem cell features such as an immature phenotype and/or self-renewal. Due to the reported proto-oncogenic role of CASC15 in childhood AML, 2 we further explored CASC15 in the context of adult AML, especially in patients with mutated isocitrate dehydrogenase (IDH).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».