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Enregistrement W2998822731 · doi:10.1136/jclinpath-2019-206256

Correlation of mismatch repair protein deficiency, PD-L1 and CD8 expression in high-grade urothelial carcinoma of the bladder

2020· article· en· W2998822731 sur OpenAlexaff
Anjelica Hodgson, Danny Vesprini, Stanley K. Liu, Bin Xu, Michelle R. Downes

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMSH2PMS2MSH6Tissue microarrayDNA mismatch repairPD-L1Urothelial carcinomaCD8Cytotoxic T cellMedicineBladder cancerMLH1CarcinomaImmune systemImmune checkpointCancer researchImmunohistochemistryPathologyInternal medicineBiologyImmunologyImmunotherapyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mismatch repair-deficient (d-MMR) tumours have been reported to show susceptibility to immune checkpoint inhibitors targeting programmed death-1/PD ligand-1 (PD-1/PD-L1). In this study, we sought to correlate the association of d-MMR, PD-L1 and CD8 expression in muscle invasive, high-grade urothelial carcinoma (HGUC) of bladder. A tissue microarray (TMA) was constructed from 201 cases and sequentially stained with PD-L1, CD8, MSH2, MSH6, MLH1 and PMS2. PD-L1 was assessed in tumour and immune cells. CD8 was assessed in a hotspot fashion with results averaged across cores. Loss of nuclear MMR expression on TMA sections was further assessed using corresponding whole tissue sections. d-MMR was identified in four cases (2%). The mean CD8 count was significantly higher in d-MMR tumours (10 vs 35, p=0.007) as was the proportion of PD-L1 positivity (75% vs 20%, p=0.031). d-MMR is uncommon in HGUC of bladder but shows strong correlation with cytotoxic T lymphocyte infiltration and PD-L1 tissue expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,248

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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