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Enregistrement W2999276655 · doi:10.1038/s41467-019-13855-2

Immune-mediated genetic pathways resulting in pulmonary function impairment increase lung cancer susceptibility

2020· article· en· W2999276655 sur OpenAlexafffund
Linda Kachuri, Mattias Johansson, Sara R. Rashkin, Rebecca E. Graff, Yohan Bossé, Venkata Manem, Neil E. Caporaso, Maria Teresa Landi, David C. Christiani, Paolo Vineis, Geoffrey Liu, Ghislaine Scélo, Давид Заридзе, Sanjay Shete, Demetrius Albanes, Melinda C. Aldrich, Adonina Tardón, Gad Rennert, Chu Chen, Gary E. Goodman, Jennifer A. Doherty, Heike Bickeböller, John K. Field, Michael P.A. Davies, M. Dawn Teare, Lambertus A. Kiemeney, Stig E. Bojesen, Aage Haugen, Shanbeh Zienolddiny, Stephen Lam, Loı̈c Le Marchand, Iona Cheng, Matthew B. Schabath, Eric J. Duell, Angeline S. Andrew, Jonas Manjer, Philip Lazarus, Susanne M. Arnold, James McKay, Nima C. Emami, Matthew T. Warkentin, Yonathan Brhane, Ma’en Obeidat, Richard M. Martin, Caroline L. Relton, George Davey Smith, Philip Haycock, Christopher I. Amos, Paul Brennan, John S. Witte, Rayjean J. Hung

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaPublic Health OntarioBC Cancer AgencyPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health NetworkInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversité LavalSinai Health SystemLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université LavalGovernment of CanadaUniversity of BristolDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteNational Institute for Health and Care ResearchWorld Health OrganizationRoy Castle Lung Cancer FoundationUniversité LavalCentre International de Recherche sur le CancerU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthCancer Research UKUniversity Hospitals Bristol NHS Foundation Trust
Mots-clésLung cancerImmune systemMedicinePulmonary function testingBiologyLungImmunologyCancer researchGeneticsBioinformaticsPathologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Impaired lung function is often caused by cigarette smoking, making it challenging to disentangle its role in lung cancer susceptibility. Investigation of the shared genetic basis of these phenotypes in the UK Biobank and International Lung Cancer Consortium (29,266 cases, 56,450 controls) shows that lung cancer is genetically correlated with reduced forced expiratory volume in one second (FEV 1 : r g = 0.098, p = 2.3 × 10 −8 ) and the ratio of FEV 1 to forced vital capacity (FEV 1 /FVC: r g = 0.137, p = 2.0 × 10 −12 ). Mendelian randomization analyses demonstrate that reduced FEV 1 increases squamous cell carcinoma risk (odds ratio (OR) = 1.51, 95% confidence intervals: 1.21–1.88), while reduced FEV 1 /FVC increases the risk of adenocarcinoma (OR = 1.17, 1.01–1.35) and lung cancer in never smokers (OR = 1.56, 1.05–2.30). These findings support a causal role of pulmonary impairment in lung cancer etiology. Integrative analyses reveal that pulmonary function instruments, including 73 novel variants, influence lung tissue gene expression and implicate immune-related pathways in mediating the observed effects on lung carcinogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,701
Score d'incertitude au seuil0,776

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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