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Enregistrement W2999295875 · doi:10.1093/rheumatology/kez615

Clinical and associated inflammatory biomarker features predictive of short-term outcomes in non-systemic juvenile idiopathic arthritis

2019· article· en· W2999295875 sur OpenAlexafffund
Elham Rezaei, Daniel J. Hogan, Brett Trost, Anthony Kusalik, Gilles Boire, David A. Cabral, Sarah Campillo, Gaëlle Chédeville, Anne-Laure Chetaille, Paul Dancey, Ciarán M. Duffy, Karen Watanabe Duffy, John Gordon, Jaime Guzmán, Kristin Houghton, Adam M. Huber, Roman Juřenčák, Bianca Lang, Kimberly Morishita, Kiem Oen, Ross E. Petty, Suzanne Ramsey, Rosie Scuccimarri, Lynn Spiegel, Elizabeth Stringer, Regina M. Taylor‐Gjevre, Shirley M. L. Tse, Lori B. Tucker, Stuart E. Turvey, Susan Tupper, Rae S. M. Yeung, Susanne M. Benseler, Janet Ellsworth, Chantal Guillet, Chandima Karananayake, Nazeem Muhajarine, Johannes Roth, Rayfel Schneider, Alan Rosenberg

Notice bibliographique

RevueLara D. Veeken · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutoimmune and Inflammatory Disorders Research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaHôpital FleurimontUniversity of CalgaryChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversité de SherbrookeUniversity of TorontoDalhousie UniversityBC Children's HospitalUniversity of ManitobaIzaak Walton Killam Health CentreCentre hospitalier universitaire de QuébecJaneway Children's Health and Rehabilitation CentreMcGill University Health CentreHospital for Sick ChildrenUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesInstitute of Musculoskeletal Health and ArthritisInstitute of Infection and ImmunityCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Arthritis NetworkArthritis SocietyUniversity of SaskatchewanUniversity of British ColumbiaMcGill University
Mots-clésMedicineBiomarkerInternal medicineCohortProspective cohort studyArthritisDiseaseArea under the curve

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To identify early predictors of disease activity at 18 months in JIA using clinical and biomarker profiling. METHODS: Clinical and biomarker data were collected at JIA diagnosis in a prospective longitudinal inception cohort of 82 children with non-systemic JIA, and their ability to predict an active joint count of 0, a physician global assessment of disease activity of ≤1 cm, and inactive disease by Wallace 2004 criteria 18 months later was assessed. Correlation-based feature selection and ReliefF were used to shortlist predictors and random forest models were trained to predict outcomes. RESULTS: From the original 112 features, 13 effectively predicted 18-month outcomes. They included age, number of active/effused joints, wrist, ankle and/or knee involvement, ESR, ANA positivity and plasma levels of five inflammatory biomarkers (IL-10, IL-17, IL-12p70, soluble low-density lipoprotein receptor-related protein 1 and vitamin D), at enrolment. The clinical plus biomarker panel predicted active joint count = 0, physician global assessment ≤ 1, and inactive disease after 18 months with 0.79, 0.80 and 0.83 accuracy and 0.84, 0.83, 0.88 area under the curve, respectively. Using clinical features alone resulted in 0.75, 0.72 and 0.80 accuracy, and area under the curve values of 0.81, 0.78 and 0.83, respectively. CONCLUSION: A panel of five plasma biomarkers combined with clinical features at the time of diagnosis more accurately predicted short-term disease activity in JIA than clinical characteristics alone. If validated in external cohorts, such a panel may guide more rationally conceived, biologically based, personalized treatment strategies in early JIA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,727

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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