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Enregistrement W2999546369 · doi:10.3389/fncel.2019.00589

VIP/PACAP-Based Drug Development: The ADNP/NAP-Derived Mirror Peptides SKIP and D-SKIP Exhibit Distinctive in vivo and in silico Effects

2020· article· en· W2999546369 sur OpenAlexfundno aff
Shlomo Sragovich, Noy Amram, Adva Yeheskel, Illana Gozes

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular Neuroscience · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuropeptides and Animal Physiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesTel Aviv UniversityMcGill UniversityIsrael Science FoundationFundación Alicia Koplowitz
Mots-clésNeuroprotectionNapIn silicoVasoactive intestinal peptideBiologyHaploinsufficiencyPeptideIn vivoNeuroscienceNeuropeptidePhenotypeGeneBiochemistryGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Activity-dependent neuroprotective protein (ADNP) was discovered and first characterized in the laboratory of Prof. Illana Gozes to be regulated by vasoactive intestinal peptide (VIP), and pituitary adenylate cyclase-activating peptide (PACAP) toward neuroprotection. Importantly, ADNP is a master regulator of >400 genes, essential for brain formation, while its haploinsufficiency causes cognitive impairments. Recently, de novo mutations in ADNP were identified as leading to the autism-like ADNP syndrome, mimicked by the Adnp-deficient mouse model. Furthermore, novel peptide derivatives of the neuroprotective ADNP-snippet NAP (NAPVSIPQ), developed in our laboratory, include SKIP and the mirroring all D-amino acid SKIP (D-SKIP). We now extended previous evidence suggesting potential antagonistic features for D-SKIP, compared with the neuroprotective peptide SKIP, as was observed by NMR analysis and social/olfactory functional testing. Here, an impact of the Adnp genotype was observed in the Morris Water Maze (MWM) test measuring cognition, coupled with improvement by SKIP, opposing the inert/exacerbating effect of D-SKIP. In the elevated plus maze and open field tests measuring anxiety-related behaviors, contrasting effects of SKIP and D-SKIP were found, with SKIP improving/preserving the normal phenotype of the mouse, and D-SKIP causing alterations. Lastly, an in silico analysis suggested that SKIP and D-SKIP bind the microtubule end binding (EB) proteins EB1 and EB3 in different conformations, thereby indicating distinctive natures for the two peptides, potentially mediating differential in vivo effects. Altogether, our findings corroborate the notion of D-SKIP acting as an antagonist, thus distinguishing it from the neuroprotective SKIP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,123
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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