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Enregistrement W2999779152 · doi:10.1093/cid/ciaa016

Cerebrospinal Fluid Early Fungicidal Activity as a Surrogate Endpoint for Cryptococcal Meningitis Survival in Clinical Trials

2020· article· en· W2999779152 sur OpenAlexfundno aff
Matthew F Pullen, Katherine Huppler Hullsiek, Joshua Rhein, Abdu K Musubire, Lillian Tugume, Edwin Nuwagira, Mahsa Abassi, Kenneth Ssebambulidde, Edward Mpoza, Ruben Kiggundu, Andrew Akampurira, Henry W. Nabeta, Charlotte Schutz, Emily E Evans, Radha Rajasingham, Caleb P Skipper, Katelyn A Pastick, Darlisha A Williams, Bożena M Morawski, Ananta Bangdiwala, Graeme Meintjes, Conrad Muzoora, David B. Meya, David R. Boulware

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFogarty International CenterNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesGrand Challenges CanadaNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilSouth African Medical Research CouncilDepartment of Science and Technology, Republic of South AfricaWellcome TrustNational Department of Health
Mots-clésMedicineSurrogate endpointAmphotericin BClinical endpointFluconazoleCryptococcal meningitisFlucytosineInternal medicineCerebrospinal fluidConfidence intervalHazard ratioGastroenterologyMeningitisPleocytosisCryptococcusClinical trialImmunologySurgeryAntifungalMicrobiologyBiologyHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In cryptococcal meningitis phase 2 clinical trials, early fungicidal activity (EFA) of Cryptococcus clearance from cerebrospinal fluid (CSF) is used as a surrogate endpoint for all-cause mortality. The Food and Drug Administration allows for using surrogate endpoints for accelerated regulatory approval, but EFA as a surrogate endpoint requires further validation. We examined the relationship between rate of CSF Cryptococcus clearance (EFA) and mortality through 18 weeks. METHODS: We pooled individual-level CSF data from 3 sequential cryptococcal meningitis clinical trials conducted during 2010-2017. All 738 subjects received amphotericin + fluconazole induction therapy and had serial quantitative CSF cultures. The log10-transformed colony-forming units (CFUs) per mL CSF were analyzed by general linear regression versus day of culture over the first 10 days. RESULTS: Mortality through 18 weeks was 37% for EFA > = 0.60 (n = 170), 36% for 0.40-0.59 (n = 182), 39% for 0.30-0.39 (n = 112), 35% for 0.20-0.29 (n = 87), and 50% for those with EFA < 0.20 CFU/mL/day (n = 187). The hazard ratio for 18-week mortality, comparing those with EFA < 0.20 to those with EFA > = 0.20, was 1.60 (95% confidence interval, 1.25, 2.04; P = .002). The lowest EFA group had lower median CD4 T-cell counts (P < .01) and lower proportion of patients with CSF pleocytosis (P < .001). CONCLUSIONS: EFA is associated with all-cause mortality in cryptococcal meningitis. An EFA threshold of > = 0.20 log10 CFU/mL/day was associated with similar 18-week mortality (37%) compared to 50% mortality with EFA < 0.20. This EFA threshold may be considered a target for a surrogate endpoint. This builds upon existing studies to validate EFA as a surrogate endpoint.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,125
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,094
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil0,664

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1250,094
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,005
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,226
Tête enseignante GPT0,484
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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