High levels of genetically intact HIV in HLA-DR+ memory T cells indicates their value for reservoir studies
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: The contribution of HLA-DR+ memory CD4 T cells to the HIV reservoir during prolonged antiretroviral therapy is unclear as these cells are commonly excluded when assessing for replication-competent HIV. To address this issue, we examined the distribution of genetically intact HIV DNA within HLA-DR- and HLA-DR+ memory CD4 T cells and the RNA transcriptional profile of these cells during antiretroviral therapy. DESIGN/METHODS: Full-length DNA sequencing was used to examine the HIV DNA landscape within HLA-DR+ and HLA-DR- memory CD4 T cells. RNA quantification and sequencing was used to interrogate the relationship between HLA-DR status and HIV RNA transcription. RESULTS: HLA-DR+ CD4 T cells contained a high frequency of genetically intact HIV genomes, contributing over half of the genetically intact viral sequences to the reservoir. Expansions of genetically identical sequences were identified in all T-cell subsets, indicating that cellular proliferation maintains genetically intact and defective viral DNA during therapy. Intracellular HIV RNA levels in HLA-DR+ and HLA-DR- T cells were not statistically different by either long terminal repeat quantitative PCR quantification or single-genome RNA sequencing of the p6-RT region. CONCLUSION: The high proportion of intact viral DNA sequences in the proliferative HLA-DR+ subset suggests they are critical in maintaining HIV infection during effective therapy. As such, these cells should be included in any immune intervention targeting HIV during effective therapy.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».