Diverse <i>AR</i> Gene Rearrangements Mediate Resistance to Androgen Receptor Inhibitors in Metastatic Prostate Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose: Prostate cancer is the second leading cause of male cancer deaths. Castration-resistant prostate cancer (CRPC) is a lethal stage of the disease that emerges when endocrine therapies are no longer effective at suppressing activity of the androgen receptor (AR) transcription factor. The purpose of this study was to identify genomic mechanisms that contribute to the development and progression of CRPC. Experimental Design: We used whole-genome and targeted DNA-sequencing approaches to identify mechanisms underlying CRPC in an aggregate cohort of 272 prostate cancer patients. We analyzed structural rearrangements at the genome-wide level and carried out a detailed structural rearrangement analysis of the AR locus. We used genome engineering to perform experimental modeling of AR gene rearrangements and long-read RNA sequencing to analyze effects on expression of AR and truncated AR variants (AR-V). Results: AR was among the most frequently rearranged genes in CRPC tumors. AR gene rearrangements promoted expression of diverse AR-V species. AR gene rearrangements occurring in the context of AR amplification correlated with AR overexpression. Cell lines with experimentally derived AR gene rearrangements displayed high expression of tumor-specific AR-Vs and were resistant to endocrine therapies, including the AR antagonist enzalutamide. Conclusions: AR gene rearrangements are an important mechanism of resistance to endocrine therapies in CRPC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».