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Enregistrement W3000572934 · doi:10.1074/jbc.ra119.011775

The motif EXEXXXL in the cytosolic tail of the secretory human proprotein convertase PC7 regulates its trafficking and cleavage activity

2020· article· en· W3000572934 sur OpenAlexafffund
Loreleï Durand, Stéphanie Duval, Alexandra Evagelidis, Johann Guillemot, Vahid Dianati, Emilia Sikorska, Peter Schu, Robert Day, Nabil G. Seidah

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsGovernment of Canada
Mots-clésProprotein ConvertasesFurinProprotein convertaseKexinEndosomeSerineCell biologySignal transducing adaptor proteinCleavage (geology)Golgi apparatusTransmembrane proteinCytosolProteasesBiologyEndocytosisTransmembrane domainBiochemistryReceptorEndoplasmic reticulumSignal transductionLDL receptorEnzymePhosphorylationIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many secretory proteins are activated by cleavage at specific sites. The proprotein convertases (PCs) form a family of nine secretory subtilisin-like serine proteases, seven of which cleave at specific basic residues within the trans -Golgi network, granules, or at the cell surface/endosomes. The seventh member, PC7, is a type-I transmembrane (TM) protein with a 97-residue–long cytosolic tail (CT). PC7 sheds human transferrin receptor 1 (hTfR1) into soluble shTfR1 in endosomes. To better understand the physiological roles of PC7, here we focused on the relationship between the CT-regulated trafficking of PC7 and its ability to shed hTfR1. Deletion of the TMCT resulted in soluble PC7 and loss of its hTfR1 shedding activity. Extensive CT deletions and mutagenesis analyses helped us zoom in on three residues in the CT, namely Glu-719, Glu-721, and Leu-725, that are part of a novel motif, E X E XXX L 725 , critical for PC7 activity on hTfR1. NMR studies of two 14-mer peptides mimicking this region of the CT and its Ala variants revealed that the three exposed residues are on the same side of the molecule. This led to the identification of adaptor protein 2 (AP-2) as a protein that recognizes the E X E XXX L 725 motif, thus representing a potentially new regulator of PC7 trafficking and cleavage activity. Immunocytochemistry of the subcellular localization of PC7 and its Ala variants of Leu-725 and Glu-719 and Glu-721 revealed that Leu-725 enhances PC7 localization to early endosomes and that, together with Glu-719 and Glu-721, it increases the endosomal activity of PC7 on hTfR1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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